RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 CCDC17Q96LX7 622 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 SLC9A7Q96T83 725 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 KANSL2Q9H9L4 492 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 NDUFB10O96000 172 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 PFKMP08237 780 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 FAM133AQ8N9E0 248 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 HOMER2Q9NSB8 354 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 TNKSO95271 1327 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 USP17L12C9JPN9 530 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 USP17L21D6R901 530 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 KCNA5P22460 613 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 LEXMQ3ZCV2 418 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 TAPT1Q6NXT6 567 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 KIFC2Q96AC6 838 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 MTUS1Q9ULD2 1270 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 F5H6K3 240 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 MBD4O95243 580 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 KLRC3Q07444 240 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 EEPD1Q7L9B9 569 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 AP5M1Q9H0R1 490 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 SUGCTQ9HAC7 445 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 MYH4Q9Y623 1939 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-230ENST00000551968 SIP14410 1827 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 GOLIM4O00461 696 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 ZBED4O75132 1171 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 AACSQ86V21 672 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 C5orf42Q9H799 3197 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 CFAP54Q96N23 3096 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 POTEB3A0JP26 581 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 IQCF3P0C7M6 154 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 ACTN1P12814 892 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 ALADP13716 330 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 GPNMBQ14956 572 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 TCTN1Q2MV58 587 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 POTEBQ6S5H4 581 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 CHST13Q8NET6 341 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 GRXCR2A6NFK2 248 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 ZEB2O60315 1214 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 DEFB103AP81534 67 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 CTR9Q6PD62 1173 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 STK11IPQ8N1F8 1099 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 FBXO40Q9UH90 709 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.43■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 KIF28PB7ZC32 967 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 DCXO43602 365 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 RASA1P20936 1047 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 WDR5P61964 334 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 ZNF536O15090 1300 aa16.42■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 H3BQ06 376 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 RFC2P35250 354 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 NBPF20Q3BBV1 942 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 ACAD9Q9H845 621 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 RNF146Q9NTX7 359 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 NYAP2Q9P242 653 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 CLIP2Q9UDT6 1046 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 Q9Y3F1 56 aa16.41■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 ASB14A6NK59 587 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 MYL3P08590 195 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 ADD2P35612 726 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 OAZ1P54368 228 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 ERVK-21P61565 698 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 FAM47CQ5HY64 1035 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 PRSS33Q8NF86 280 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 KCNH6Q9H252 994 aa16.4■□□□□ 0.22
CS-230ENST00000551968 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-230ENST00000551968 LINC01553A4QN01 128 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-230ENST00000551968 SNAP25P60880 206 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-230ENST00000551968 MUM1L1Q5H9M0 696 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-230ENST00000551968 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms