RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 RFXAPO00287 272 aa8.8□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CDR1P51861 262 aa8.8□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TMEM62Q0P6H9 643 aa8.8□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ESR2Q92731 530 aa8.8□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.8□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.8□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 SWAP70Q9UH65 585 aa8.8□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ERICH2A1L162 156 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 KBTBD13C9JR72 458 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 KLRF2D3W0D1 207 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 UBE2SQ16763 222 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 KRT40Q6A162 431 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ARMCX2Q7L311 632 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TRIM50Q86XT4 487 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 SMC5Q8IY18 1101 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ARMC5Q96C12 935 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 SH2D4AQ9H788 454 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TTC41PQ6P2S7 1318 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 MYOGP15173 224 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CHMLP26374 656 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TTC22Q5TAA0 569 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 SPRED2Q7Z698 418 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 DEFB123Q8N688 67 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 APBA2Q99767 749 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
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CS-212ENST00000548567 ASGR1P07306 291 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 RABGGTBP53611 331 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 RASEFQ8IZ41 740 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ZNF286BP0CG31 522 aa8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CSF2RAP15509 400 aa8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 PHKBQ93100 1093 aa8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 MMP14P50281 582 aa8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 MAP3K10Q02779 954 aa8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 LHX8Q68G74 356 aa8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CASC1Q6TDU7 716 aa8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.78□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 PDHBP11177 359 aa8.77□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 RTP1P59025 263 aa8.77□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 ACVR2BQ13705 512 aa8.77□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 LRRC41Q15345 812 aa8.77□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 SHHQ15465 462 aa8.77□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.77□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 SLC17A8Q8NDX2 589 aa8.77□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 EHD4Q9H223 541 aa8.77□□□□□ -1
CS-212ENST00000548567 CACNA1HO95180 2353 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 E7EWF7 191 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 GNAT2P19087 354 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 TNFAIP2Q03169 654 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 APOBRQ0VD83 1088 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 GSE1Q14687 1217 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 WTAPQ15007 396 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 SH3D19Q5HYK7 790 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 CHURC1Q8WUH1 139 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 RMDN3Q96TC7 470 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 POLD4Q9HCU8 107 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 PRC1O43663 620 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 PBX2P40425 430 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 GUCY1B3Q02153 619 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-212ENST00000548567 PDE4DQ08499 809 aa8.77□□□□□ -1.01
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