RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	ITGAV	P06756	1048 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	C8A	P07357	584 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	PRKCA	P17252	672 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	PDE6B	P35913	854 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	SEPHS1	P49903	392 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	RAB33A	Q14088	237 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	JAML	Q86YT9	394 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	NUP43	Q8NFH3	380 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	KCNK12	Q9HB15	430 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	OR14I1	A6ND48	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	TBX1	O43435	398 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64	8e-7	■■□□□ 12.2
MDM2-233	ENST00000545204	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	ERVFRD-1	P60508	538 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	MVK	Q03426	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	LAPTM5	Q13571	262 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	SV2C	Q496J9	727 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	COPS5	Q92905	334 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	EPN3	Q9H201	632 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	HRK	O00198	91 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	SDHB	P21912	280 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	L1CAM	P32004	1257 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	ARL4A	P40617	200 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	CORO7	P57737	925 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	CYP4F8	P98187	520 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	SCRN1	Q12765	414 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	SLC38A3	Q99624	504 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204		A0A1W2PQ27	194 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204		A0A1W2PQ64	194 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204		A0A1W2PQC6	194 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204		A0A1W2PQD8	194 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	PEX10	O60683	326 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	TSPAN15	O95858	294 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	KRT1	P04264	644 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	CAPNS1	P04632	268 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	THBD	P07204	575 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	PLS3	P13797	630 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	PAM	P19021	973 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF124	Q15973	351 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	AGRP	O00253	132 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	SEMA7A	O75326	666 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	MPO	P05164	745 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	SCG5	P05408	212 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	HOXC12	P31275	282 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	PKN1	Q16512	942 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	MMP19	Q99542	508 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204		A0A1W2PQU0	124 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	C7orf72	A4D263	438 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MDM2-233	ENST00000545204	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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