RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	AIFM3	Q96NN9	605 aa		13.68	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.68	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.68	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.68	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	SLC25A27	O95847	323 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	ERVK-24	P63145	666 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	GUCY1B3	Q02153	619 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.67	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	CA12	O43570	354 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	STX6	O43752	255 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	KRT2	P35908	639 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	KRT40	Q6A162	431 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	GALNT17	Q6IS24	598 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	REPS2	Q8NFH8	660 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF536	O15090	1300 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	ESYT2	A0FGR8	921 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	TLR2	O60603	784 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	MMP1	P03956	469 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	SYT1	P21579	422 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	NUCB2	P80303	420 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.65	□□□□□ -0.22
DDB1-223	ENST00000543658	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	CFB	P00751	764 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	CRHR2	Q13324	411 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.64	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	CNMD	O75829	334 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	ERCC3	P19447	782 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	MROH8	Q9H579	483 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	PFAS	O15067	1338 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.63	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	TRPA1	O75762	1119 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	MAPK4	P31152	587 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	KCTD2	Q14681	263 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	KIF22	Q14807	665 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	MMP19	Q99542	508 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	MAF1	Q9H063	256 aa		13.62	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
DDB1-223	ENST00000543658	LCT	P09848	1927 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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