RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 SMC2O95347 1197 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 PRR29P0C7W0 189 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 MLKLQ8NB16 471 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 NDUFB10O96000 172 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 LRMPQ12912 555 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 IFNKQ9P0W0 207 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 BMP6P22004 513 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC1A4P43007 532 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA20Q8TB22 786 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A087X0B3 334 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 MORC3Q14149 939 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 MTMR8Q96EF0 704 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L10C9JJH3 530 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 GSDMDP57764 484 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 GMCL1Q96IK5 515 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 TMX2Q9Y320 296 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 NAPAP54920 295 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 FANCCQ00597 558 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 PAGE5Q96GU1 130 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 GGA3Q9NZ52 723 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-211ENST00000539589 TPM2P07951 284 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 IQUBQ8NA54 791 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 COA7Q96BR5 231 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 C6orf50Q9HD87 102 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 GNA11P29992 359 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 CBFA2T2O43439 604 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 AFMP43652 599 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 IL17AQ16552 155 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 SMCO2A6NFE2 343 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 ASNSP08243 561 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP1A3P13637 1013 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 TXLNAP40222 546 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 INF2Q27J81 1249 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 FANCLQ9NW38 375 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 FZD1Q9UP38 647 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 DOCK1Q14185 1865 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 LAD1O00515 517 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINC1P01008 464 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 BMP3P12645 472 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 GSDMAQ96QA5 445 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBTB5O15062 677 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 INPP5BP32019 993 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 UBASH3AP57075 661 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 E2F4Q16254 413 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM232C9JQI7 657 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 DPYDQ12882 1025 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 ARID5BQ14865 1188 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 TMC6Q7Z403 805 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 ESYT2A0FGR8 921 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 BTNL9Q6UXG8 535 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 DLK2Q6UY11 383 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 VCPKMTQ9H867 229 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 SKILP12757 684 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 SNAP25P60880 206 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-211ENST00000539589 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms