RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP13.74□□□□□ -0.21
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LMO3-218ENST00000538020 CLEC4DQ8WXI8 215 aa13.69□□□□□ -0.22
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