RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 C6orf50Q9HD87 102 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.16■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP2B1P20020 1258 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXO11Q86XK2 927 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM260Q9NX78 707 aa25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 PTMSP20962 102 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 MAP2K2P36507 400 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 AMNQ9BXJ7 453 aa25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PACSIN3-209ENST00000532457 GNA11P29992 359 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 USH1GQ495M9 461 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC174Q6PII3 467 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.14■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 UBE2HP62256 183 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC39A14Q15043 492 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 CCL15Q16663 113 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 RILPL1Q5EBL4 403 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.13■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 OPLAHO14841 1288 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 YEATS4O95619 227 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 ADCY7P51828 1080 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 UBE2SQ16763 222 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 GADL1Q6ZQY3 521 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.12■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF536O15090 1300 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 AOC2O75106 756 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 FLOT1O75955 427 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 STK38Q15208 465 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.11■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 PTPRFP10586 1907 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 SPTLC2O15270 562 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 EDIL3O43854 480 aa25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L15C9J2P7 530 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L11C9JVI0 530 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L18D6R9N7 530 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L22D6RA61 530 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L19D6RCP7 530 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L20D6RJB6 530 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 TM4SF4P48230 202 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L24Q0WX57 530 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF174Q15697 407 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 INF2Q27J81 1249 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 TREML2Q5T2D2 321 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 RLFQ13129 1914 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.618e-7■■■■■ 45.2
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.09■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 MEIS2O14770 477 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 TTC38Q5R3I4 469 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 BICD2Q8TD16 824 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 TBC1D5Q92609 795 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 CUL5Q93034 780 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 ATG4CQ96DT6 458 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.08■■□□□ 1.61
PACSIN3-209ENST00000532457 ME1P48163 572 aa25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 ZIC5Q96T25 663 aa25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 PARP14Q460N5 1801 aa25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 LIG1P18858 919 aa25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 MOGSQ13724 837 aa25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.07■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 VWA5AO00534 786 aa25.06■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 DSG3P32926 999 aa25.06■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.06■■□□□ 1.6
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.06■■□□□ 1.6
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