RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 IQCDQ96DY2 449 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SH2D4AQ9H788 454 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 DNAJC18Q9H819 358 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 DBNDD1Q9H9R9 158 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 RWDD2AQ9UIY3 292 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ABCB11O95342 1321 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 A0A1B0GTH6 734 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 FAM205CA6NFA0 338 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 H7C1D1 291 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PIK3CDO00329 1044 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 MCM7P33993 719 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 UBASH3AP57075 661 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 NFIAQ12857 509 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PICALMQ13492 652 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TMEM266Q2M3C6 531 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ABCB5Q2M3G0 1257 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CFAP100Q494V2 611 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CDKAL1Q5VV42 579 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 RRAGBQ5VZM2 374 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SLC51AQ86UW1 340 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 VSTM4Q8IW00 320 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 DHX58Q96C10 678 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 EPSTI1Q96J88 318 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PIGSQ96S52 555 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TMX1Q9H3N1 280 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 A0A087X0B3 334 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 YDJCA8MPS7 323 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 FDX1P10109 184 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PYGBP11216 843 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 KCNA3P22001 575 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 MUTP22033 750 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PTGS1P23219 599 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CIITAP33076 1130 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 STAT6P42226 847 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SLC1A4P43007 532 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SCNN1DP51172 638 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 GHRHRQ02643 423 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ICA1Q05084 483 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PSMD2Q13200 908 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 STIM1Q13586 685 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TRIM14Q14142 442 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 IL17AQ16552 155 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 AOC3Q16853 763 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 INF2Q27J81 1249 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 FILIP1LQ4L180 1135 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 NAALADL2Q58DX5 795 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SLFN13Q68D06 897 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 USP49Q70CQ1 688 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 FAM160B2Q86V87 743 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 IFNL1Q8IU54 200 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TBCKQ8TEA7 893 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CRYGNQ8WXF5 182 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CCDC51Q96ER9 411 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 CALML4Q96GE6 196 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 AMNQ9BXJ7 453 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 IFNKQ9P0W0 207 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 PIM2Q9P1W9 311 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 TMX2Q9Y320 296 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 MYH7BA7E2Y1 1941 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 BICDL2A1A5D9 508 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 F8W031 263 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PACS1-211ENST00000531298 WNT7AO00755 349 aa8.49□□□□□ -1.05
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