RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 ABHD4Q8TB40 342 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 MYLIPQ8WY64 445 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 PSMD1Q99460 953 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 ZMYM5Q9UJ78 669 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 NCOA1Q15788 1441 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 LTBP3Q9NS15 1303 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGAP5Q13017 1502 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 HPXP02790 462 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 GLI1P08151 1106 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 GNPTABQ3T906 1256 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 PRR13Q9NZ81 148 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 MAST1Q9Y2H9 1570 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 CLSPNQ9HAW4 1339 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 ABCC1P33527 1531 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1W2PQH9 124 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 SHOXO15266 292 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 CYB5RLQ6IPT4 315 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 MPZL3Q6UWV2 235 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 SYCP2Q9BX26 1530 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-214ENST00000530727 FITM1A5D6W6 292 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 CRTC3Q6UUV7 619 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 TANGO6Q9C0B7 1094 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 LNPKQ9C0E8 428 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHB10Q9UN67 800 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC141Q6ZP82 1450 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 GLI2P10070 1586 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 RAB11FIP3O75154 756 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 CD247P20963 164 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 BMP8BP34820 402 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 SLC7A5Q01650 507 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 CHRNEQ04844 493 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 TCEAL1Q15170 157 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 OGFOD2Q6N063 350 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 SPPL2CQ8IUH8 684 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 ANKS4BQ8N8V4 417 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 C19orf44Q9H6X5 657 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 GP6Q9HCN6 339 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 FAM53CQ9NYF3 392 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 C9orf84Q5VXU9 1444 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM82A0PJX8 343 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 LRRC10BA6NIK2 292 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 GSNP06396 782 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 ITGA4P13612 1032 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 CTSKP43235 329 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 LILRA2Q8N149 483 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 BRF1Q92994 677 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 MRVI1Q9Y6F6 885 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 PLXNC1O60486 1568 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 FANCAO15360 1455 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 CASP7P55210 303 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF445P59923 1031 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 MLANAQ16655 118 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 LINC01599Q8WXQ3 324 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 HAUS7Q99871 368 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 TINF2Q9BSI4 451 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 CDADC1Q9BWV3 514 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 EBF1Q9UH73 591 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 H0Y8X5 98 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 USP2O75604 605 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 ARID5AQ03989 594 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 NR0B2Q15466 257 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 VHLLQ6RSH7 139 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 ZPBP2Q6X784 338 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 FIBCD1Q8N539 461 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 MAP6Q96JE9 813 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 G6PC3Q9BUM1 346 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-214ENST00000530727 GBP3Q9H0R5 595 aa5.62□□□□□ -1.51
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