RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529230.5

CKAP5-210, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CKAP5, Length 7,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-210ENST00000529230 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
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CKAP5-210ENST00000529230 BRF1Q92994 677 aa5.86□□□□□ -1.47
CKAP5-210ENST00000529230 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
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CKAP5-210ENST00000529230 SEPT8Q92599 483 aa5.86□□□□□ -1.47
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CKAP5-210ENST00000529230 MROH7Q68CQ1 1323 aa5.86□□□□□ -1.47
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CKAP5-210ENST00000529230 DGKDQ16760 1214 aa5.86□□□□□ -1.47
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CKAP5-210ENST00000529230 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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CKAP5-210ENST00000529230 SCFD2Q8WU76 684 aa5.84□□□□□ -1.47
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CKAP5-210ENST00000529230 LZTS2Q9BRK4 669 aa5.84□□□□□ -1.47
CKAP5-210ENST00000529230 POTEFA5A3E0 1075 aa5.84□□□□□ -1.47
CKAP5-210ENST00000529230 TPM2P07951 284 aa5.84□□□□□ -1.47
CKAP5-210ENST00000529230 CTNNB1P35222 781 aa5.84□□□□□ -1.47
CKAP5-210ENST00000529230 PPFIA1Q13136 1202 aa5.84□□□□□ -1.47
CKAP5-210ENST00000529230 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CKAP5-210ENST00000529230 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa5.84□□□□□ -1.47
CKAP5-210ENST00000529230 Q6ZUG5 572 aa5.84□□□□□ -1.47
CKAP5-210ENST00000529230 MTMR14Q8NCE2 650 aa5.84□□□□□ -1.47
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