RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
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PACSIN3-204ENST00000528201 PNMA1Q8ND90 353 aa28.11■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 CLEC4DQ8WXI8 215 aa28.11■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
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PACSIN3-204ENST00000528201 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.1■■■□□ 2.09
PACSIN3-204ENST00000528201 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
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PACSIN3-204ENST00000528201 A0A1W2PQY0 241 aa28.09■■■□□ 2.09
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PACSIN3-204ENST00000528201 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
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PACSIN3-204ENST00000528201 TLE2Q04725 743 aa28.07■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 KCNA10Q16322 511 aa28.07■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC178Q5BJE1 867 aa28.07■■■□□ 2.08
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PACSIN3-204ENST00000528201 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa28.07■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 KRT23Q9C075 422 aa28.07■■■□□ 2.08
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PACSIN3-204ENST00000528201 KAT14Q9H8E8 782 aa28.07■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 PDLIM7Q9NR12 457 aa28.07■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 ASB14A6NK59 587 aa28.06■■■□□ 2.08
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PACSIN3-204ENST00000528201 CYP21A2P08686 494 aa28.06■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM63BQ5T3F8 832 aa28.06■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 SKAP1Q86WV1 359 aa28.06■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 CNNM2Q9H8M5 875 aa28.06■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 PDGFCQ9NRA1 345 aa28.06■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 MCM3APO60318 1980 aa28.06■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM43BA6NCK2 446 aa28.05■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 CST5P28325 142 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 GJA9P57773 515 aa28.05■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 SEC23AQ15436 765 aa28.05■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 TDHQ8IZJ6 230 aa28.05■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 WDR19Q8NEZ3 1342 aa28.05■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 MORC4Q8TE76 937 aa28.05■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.05■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 TAPT1Q6NXT6 567 aa28.04■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 EEPD1Q7L9B9 569 aa28.04■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 UBAC1Q9BSL1 405 aa28.04■■■□□ 2.08
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PACSIN3-204ENST00000528201 PTPDC1A2A3K4 754 aa28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 MOXD2PA6NHM9 499 aa28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 SMPD1P17405 629 aa28.02■■■□□ 2.08
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PACSIN3-204ENST00000528201 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 NKX3-2P78367 333 aa28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 TNFAIP2Q03169 654 aa28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 STOX1Q6ZVD7 989 aa28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 ADGRF4Q8IZF3 695 aa28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-204ENST00000528201 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
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PACSIN3-204ENST00000528201 RPS6P62753 249 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 BEX3Q00994 111 aa28.01■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 USH1GQ495M9 461 aa28.01■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 ASPRV1Q53RT3 343 aa28.01■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 SENP2Q9HC62 589 aa28.01■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 STARD7Q9NQZ5 370 aa28.01■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 ASGR1P07306 291 aa28■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 LRIT3Q3SXY7 679 aa28■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 RNF207Q6ZRF8 634 aa28■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 STAG2Q8N3U4 1231 aa28■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC37A2A6NM11 1700 aa28■■■□□ 2.07
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PACSIN3-204ENST00000528201 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
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PACSIN3-204ENST00000528201 E7EWF7 191 aa27.98■■■□□ 2.07
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PACSIN3-204ENST00000528201 QRICH1Q2TAL8 776 aa27.98■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa27.98■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 NUP133Q8WUM0 1156 aa27.98■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 TBC1D5Q92609 795 aa27.98■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 SPC25Q9HBM1 224 aa27.98■■■□□ 2.07
PACSIN3-204ENST00000528201 VTA1Q9NP79 307 aa27.98■■■□□ 2.07
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