RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

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Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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PTPRK-218ENST00000525459 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-218ENST00000525459 SNX21Q969T3 373 aa21.62■■□□□ 1.05
PTPRK-218ENST00000525459 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.62■■□□□ 1.05
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PTPRK-218ENST00000525459 PEX10O60683 326 aa21.61■■□□□ 1.05
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PTPRK-218ENST00000525459 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.61■■□□□ 1.05
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PTPRK-218ENST00000525459 KCTD2Q14681 263 aa21.6■■□□□ 1.05
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PTPRK-218ENST00000525459 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.6■■□□□ 1.05
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PTPRK-218ENST00000525459 MCF2L2Q86YR7 1114 aa21.6■■□□□ 1.05
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PTPRK-218ENST00000525459 PHKBQ93100 1093 aa21.6■■□□□ 1.05
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PTPRK-218ENST00000525459 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-218ENST00000525459 PTPREP23469 700 aa21.59■■□□□ 1.05
PTPRK-218ENST00000525459 SLC4A3P48751 1232 aa21.59■■□□□ 1.05
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PTPRK-218ENST00000525459 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.59■■□□□ 1.05
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PTPRK-218ENST00000525459 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.58■■□□□ 1.05
PTPRK-218ENST00000525459 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PTPRK-218ENST00000525459 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.58■■□□□ 1.04
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PTPRK-218ENST00000525459 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRK-218ENST00000525459 MAP2K5Q13163 448 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRK-218ENST00000525459 TRIM17Q9Y577 477 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRK-218ENST00000525459 ESYT2A0FGR8 921 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRK-218ENST00000525459 IRF5Q13568 498 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRK-218ENST00000525459 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
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PTPRK-218ENST00000525459 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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PTPRK-218ENST00000525459 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRK-218ENST00000525459 NSMFQ6X4W1 530 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRK-218ENST00000525459 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PTPRK-218ENST00000525459 CYP39A1Q9NYL5 469 aa21.54■■□□□ 1.04
PTPRK-218ENST00000525459 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRK-218ENST00000525459 STXBP3O00186 592 aa21.53■■□□□ 1.04
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