RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 FCER1AP12319 257 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 PDE4DQ08499 809 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 JADE2Q9NQC1 790 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 MYBL2P10244 700 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 TXNRD1Q16881 649 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 SMIM5Q71RC9 77 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 EHBP1Q8NDI1 1231 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 P2RX5Q93086 422 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 HPS3Q969F9 1004 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 TSPYL1Q9H0U9 437 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 HPCAL4Q9UM19 191 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 MYL1P05976 194 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC20A2Q08357 652 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 DGKHQ86XP1 1220 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 CPVLQ9H3G5 476 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 IDEP14735 1019 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 ZBED6P86452 979 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 TRIM9Q9C026 710 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 IVLP07476 585 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 MIIPQ5JXC2 388 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 CABP7Q86V35 215 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 FLT1P17948 1338 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 STXBP3O00186 592 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF263O14978 683 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 CCNE1P24864 410 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 ASIC1P78348 528 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 GRM4Q14833 912 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 MAP9Q49MG5 647 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 COG1Q8WTW3 980 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 NUP58Q9BVL2 599 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 BARHL2Q9NY43 387 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 LRRC31Q6UY01 552 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 RASSF4Q9H2L5 321 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 MCM3P25205 808 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 C2orf54Q08AI8 447 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 DDB1Q16531 1140 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 LETM2Q2VYF4 491 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 C12orf60Q5U649 245 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 GPIHBP1Q8IV16 184 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 RETREG2Q8NC44 543 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 STX8Q9UNK0 236 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 RPS6KA5O75582 802 aa24.03■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 KCNQ4P56696 695 aa24.03■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF5AQ12840 1032 aa24.03■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.03■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 GGCXP38435 758 aa24.03■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC42Q96M95 316 aa24.03■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 BICDL2A1A5D9 508 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 TSPY3P0CV98 308 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 TSPY8P0CW00 308 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 TECP42680 631 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC96Q2M329 555 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 DAGLBQ8NCG7 672 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 DRC1Q96MC2 740 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM200B-202ENST00000521452 SCN7AQ01118 1682 aa24.02■■□□□ 1.43
TMEM200B-202ENST00000521452 LAD1O00515 517 aa24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms