RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 DCAF15Q66K64 600 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 BORCS6Q96GS4 357 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFAB1O14561 156 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 PDCLQ13371 301 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 MYOZ2Q9NPC6 264 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 FAM228AQ86W67 206 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
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TRPS1-211ENST00000520276 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF213O14771 459 aa11.28□□□□□ -0.6
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TRPS1-211ENST00000520276 PPFIA1Q13136 1202 aa11.28□□□□□ -0.6
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TRPS1-211ENST00000520276 KIAA0754O94854 1291 aa11.28□□□□□ -0.6
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TRPS1-211ENST00000520276 IKQ13123 557 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
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TRPS1-211ENST00000520276 SCN7AQ01118 1682 aa11.27□□□□□ -0.6
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TRPS1-211ENST00000520276 GPAA1O43292 621 aa11.27□□□□□ -0.6
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TRPS1-211ENST00000520276 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf69Q8N8R5 385 aa11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 SLC40A1Q9NP59 571 aa11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 TRIM10Q9UDY6 481 aa11.26□□□□□ -0.61
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