RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM196AQ6ZSG2 479 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LIMS2Q7Z4I7 341 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPFIBP1Q86W92 1011 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TTC9BQ8N6N2 239 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC6A18Q96N87 628 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAMD11Q96NU1 681 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF747Q9BV97 191 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC3Q9BY71 257 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF38Q9H0F5 515 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCED1AQ9H1Q7 454 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD248Q9HCU0 757 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNQ5Q9NR82 932 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PARP2Q9UGN5 583 aa2.2□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MINDY4BA8MYZ0 360 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 F8W031 263 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GREM1O60565 184 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLEC3AO75596 197 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BRD1O95696 1058 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C8BP07358 591 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GSTM1P09488 218 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RLBP1P12271 317 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IFNGR1P15260 489 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLCQ05315 142 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AUHQ13825 339 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNAP47Q5SQN1 464 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NLGN1Q8N2Q7 840 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC9A7Q96T83 725 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARID3AQ99856 593 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GORASP1Q9BQQ3 440 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MCMBPQ9BTE3 642 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EHMT1Q9H9B1 1298 aa2.19□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM86C2PA6NEL3 165 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCAM1P13591 858 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NME1P15531 152 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SARSP49591 514 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF445P59923 1031 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C9orf131Q5VYM1 1079 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGFL4Q6B9Z1 124 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NLRC3Q7RTR2 1065 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERMP1Q7Z2K6 904 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LINC00482Q8N8I6 264 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ALG3Q92685 438 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDX11Q96FC9 970 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSPAN17Q96FV3 270 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RSRP1Q9BUV0 290 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDLIM7Q9NR12 457 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KBTBD4Q9NVX7 518 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INVSQ9Y283 1065 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa2.18□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LTBP3Q9NS15 1303 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD33BA6NCL7 494 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MEIS3P2A8K0S8 358 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYR61O00622 381 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNFRSF10CO14798 259 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR42O15529 346 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 B4GALT3O60512 393 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GSNP06396 782 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THBS2P35442 1172 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RGL3Q3MIN7 710 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR31Q5SQ13 230 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCAF15Q66K64 600 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMC4Q7Z404 712 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM26EQ8N5C1 309 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNERQ8NFT8 737 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CPA5Q8WXQ8 436 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BRF1Q92994 677 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBTB8AQ96BR9 441 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MBD6Q96DN6 1003 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTCHD1Q96NR3 888 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTPN18Q99952 460 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MTA3Q9BTC8 594 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UBP1Q9NZI7 540 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NTMQ9P121 344 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FBXL21Q9UKT6 434 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAN1Q9Y2M0 1017 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIT1Q9Y3P8 196 aa2.17□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AMHP03971 560 aa2.16□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GDF5P43026 501 aa2.16□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CORO7P57737 925 aa2.16□□□□□ -2.06
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
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