RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513815.1

LINC00491-204, long intergenic non-protein coding RNA 491, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00491, Length 582 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00491-204ENST00000513815 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
LINC00491-204ENST00000513815 Q9Y3F1 56 aa5.34□□□□□ -1.55
LINC00491-204ENST00000513815 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
LINC00491-204ENST00000513815 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 NLRC5Q86WI3 1866 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 GRIN2DO15399 1336 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 C5orf67F2Z3F1 127 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 CTAGE5O15320 804 aa5.33□□□□□ -1.56
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LINC00491-204ENST00000513815 PDE8BO95263 885 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 IQCF3P0C7M6 154 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 VCAM1P19320 739 aa5.33□□□□□ -1.56
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LINC00491-204ENST00000513815 PRDX5P30044 214 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 RHBDL3P58872 404 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 BFSP2Q13515 415 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 MTMR3Q13615 1198 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 EPC2Q52LR7 807 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 CCDC30Q5VVM6 783 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 CNKSR3Q6P9H4 555 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 DEFB128Q7Z7B8 93 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 SUMF1Q8NBK3 374 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 SUSD6Q92537 303 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
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LINC00491-204ENST00000513815 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 SORCS3Q9UPU3 1222 aa5.33□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 BPTFQ12830 3046 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 ZZEF1O43149 2961 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 SLC30A4O14863 429 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 CXCL10P02778 98 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 SLURP2P0DP57 97 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 FGFR2P21802 821 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 VASPP50552 380 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 RRP1P56182 461 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 HYAL1Q12794 435 aa5.32□□□□□ -1.56
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LINC00491-204ENST00000513815 ACVR2BQ13705 512 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 PPM1JQ5JR12 505 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 LMBR1LQ6UX01 489 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 PRR23BQ6ZRT6 265 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 DTWD2Q8NBA8 298 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 RETREG2Q8NC44 543 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 LINS1Q8NG48 757 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 CAGE1Q8TC20 777 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 CRBNQ96SW2 442 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 PCGF6Q9BYE7 350 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 TRPV6Q9H1D0 765 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 MTUS1Q9ULD2 1270 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 DENND2AQ9ULE3 1009 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 BOLA1Q9Y3E2 137 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 RWDD3Q9Y3V2 267 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 SIPA1L1O43166 1804 aa5.32□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 COL4A3Q01955 1670 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 DCDC2BA2VCK2 349 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 FAM196BA6NMK8 535 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 SPTLC1O15269 473 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 TMPOP42166 694 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 BTDP43251 543 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 RBL2Q08999 1139 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 NCAPG2Q86XI2 1143 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 RIOX2Q8IUF8 465 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 TMEM192Q8IY95 271 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 CCDC155Q8N6L0 562 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 EFHBQ8N7U6 833 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 NETO1Q8TDF5 533 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 AFAP1L1Q8TED9 768 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 MMP19Q99542 508 aa5.31□□□□□ -1.56
LINC00491-204ENST00000513815 MFSD1Q9H3U5 465 aa5.31□□□□□ -1.56
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