RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511207.5

CCNH-209, Transcript of cyclin H, human

TSL 2

Gene CCNH, Length 451 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNH-209	ENST00000511207	FAM87A	P0C7U9	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	BMP8B	P34820	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	KCNJ6	P48051	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	CYP27A1	Q02318	531 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	NBPF11	Q86T75	865 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	SCLY	Q96I15	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207		H0Y8X5	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	AURKA	O14965	403 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	OPA1	O60313	960 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	BRINP1	O60477	761 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	VAMP4	O75379	141 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	ZEB2	O60315	1214 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	CBX7	O95931	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	ECI1	P42126	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	CTSK	P43235	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	NEK4	P51957	841 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	GPR85	P60893	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	TNK2	Q07912	1038 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	SCRN1	Q12765	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	UBR7	Q8N806	425 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	BLACE	A4D250	179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	ARVCF	O00192	962 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	CRTAM	O95727	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	THBD	P07204	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	JMJD7	P0C870	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	VAV1	P15498	845 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	LTBR	P36941	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNH-209	ENST00000511207	RAX	Q9Y2V3	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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