RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507075.1

ARRDC3-204, Transcript of arrestin domain containing 3, human

TSL 2

Gene ARRDC3, Length 355 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARRDC3-204	ENST00000507075	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	PRR5	P85299	388 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	ABHD18	Q0P651	414 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	AMER2	Q8N7J2	671 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	MROH6	A6NGR9	719 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	PPFIA2	O75334	1257 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	ACR	P10323	421 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	KRTAP10-11	P60412	298 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	PSMD2	Q13200	908 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	MLEC	Q14165	292 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	BORA	Q6PGQ7	559 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	KLHL3	Q9UH77	587 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075		A0A087X1B8	175 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZNF202	O95125	648 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	PML	P29590	882 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	RNF4	P78317	190 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	FOXE3	Q13461	319 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	PWP1	Q13610	501 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	ALG3	Q92685	438 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ARRDC3-204	ENST00000507075		F8W031	263 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	B4GALT3	O60512	393 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	PRAMEF1	O95521	474 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	LMNB2	Q03252	620 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	MIIP	Q5JXC2	388 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	PHC3	Q8NDX5	983 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	USP33	Q8TEY7	942 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZG16B	Q96DA0	208 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	MRS2	Q9HD23	443 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	MCTP2	Q6DN12	878 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	PARP2	Q9UGN5	583 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	PATE3	B3GLJ2	98 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	HTR3B	O95264	441 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	GBP1	P32455	592 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	INHBC	P55103	352 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	DAB2	P98082	770 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	MPP2	Q14168	576 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM124A	Q86V42	546 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZNF503	Q96F45	646 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZNF205	O95201	554 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	F13A1	P00488	732 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	PF4	P02776	101 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	RAG1	P15918	1043 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	THBS2	P35442	1172 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	SURF1	Q15526	300 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		3.74	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81
ARRDC3-204	ENST00000507075	TMC4	Q7Z404	712 aa		3.74	□□□□□ -1.81

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