RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504457.5

NSD1-206, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 1, human

TSL 4

Gene NSD1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD1-206	ENST00000504457	TNFAIP2	Q03169	654 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	KCNA10	Q16322	511 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	CCDC96	Q2M329	555 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	DEFB123	Q8N688	67 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	RGS22	Q8NE09	1264 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	MORC4	Q8TE76	937 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	VTA1	Q9NP79	307 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	INCENP	Q9NQS7	918 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	LAMA4	Q16363	1823 aa		11.12	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	IGHD	P01880	384 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	ASGR1	P07306	291 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	PDHB	P11177	359 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	CDK7	P50613	346 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	DNER	Q8NFT8	737 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	ANKS1A	Q92625	1134 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	BAD	Q92934	168 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	FGD4	Q96M96	766 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	KRT23	Q9C075	422 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	KATNBL1	Q9H079	304 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		11.11	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	ARVCF	O00192	962 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	TIMP1	P01033	207 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	CNTN2	Q02246	1040 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	ZNF543	Q08ER8	600 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	FAAP100	Q0VG06	881 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	HAND2	P61296	217 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	FPGS	Q05932	587 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	TRAF1	Q13077	416 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	MFSD5	Q6N075	450 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	NSMF	Q6X4W1	530 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457	RAD50	Q92878	1312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
NSD1-206	ENST00000504457		A0A0C4DFX4	3053 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	KPNA6	O60684	536 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	SLC16A2	P36021	539 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	SHH	Q15465	462 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	TLK2	Q86UE8	772 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	TMEM199	Q8N511	208 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	KAT14	Q9H8E8	782 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	MTMR7	Q9Y216	660 aa		11.08	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	LCT	P09848	1927 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	CPT1A	P50416	773 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	TRDN	Q13061	729 aa		11.07	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	11.07	□□□□□ -0.64
NSD1-206	ENST00000504457	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		11.07	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms