RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 LDHAP00338 332 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 FGAP02671 866 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 RANBP1P43487 201 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CLCN2P51788 898 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 C8orf58Q8NAV2 365 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 MTMR14Q8NCE2 650 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR66Q8TBY9 1149 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 IER2Q9BTL4 223 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 TLDC2A0PJX2 215 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CLRN2A0PK11 232 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 GRM8O00222 908 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP1A2P05177 515 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPAN7P41732 249 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.581e-7■□□□□ 9.4
RABGGTB-213ENST00000496055 CCL15Q16663 113 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 GNPTABQ3T906 1256 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CFAP58Q5T655 872 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 PDXDC1Q6P996 788 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 LMBR1LQ6UX01 489 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 HOOK3Q86VS8 718 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 IFNL1Q8IU54 200 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM87BQ96K49 555 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF341Q9BYN7 854 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 PIF1Q9H611 641 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF304Q9HCX3 659 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 NUP98P52948 1817 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA0754O94854 1291 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXC13P31276 330 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 ELF1P32519 619 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 SDE2Q6IQ49 451 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 TXLNBQ8N3L3 684 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 APPL2Q8NEU8 664 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 FLCNQ8NFG4 579 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 GSDMBQ8TAX9 411 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 RAET1EQ8TD07 263 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 PIBF1Q8WXW3 757 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D20Q96BZ9 403 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 UROC1Q96N76 676 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 GMLQ99445 158 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 SH3GL1Q99961 368 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 OSBPL10Q9BXB5 764 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CFHR5Q9BXR6 569 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 CHST12Q9NRB3 414 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 SNED1Q8TER0 1413 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 KDM3BQ7LBC6 1761 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 TRPM7Q96QT4 1865 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0B4J203 849 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM25EA8MYX2 175 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 C19orf81C9J6K1 198 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP6V1G1O75348 118 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 NASPP49321 788 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 MNAT1P51948 309 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 HDAC4P56524 1084 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 MYBPC3Q14896 1274 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF18AQ8NI77 898 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM47Q96LD4 638 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 QPCTLQ9NXS2 382 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 HDAC6Q9UBN7 1215 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGGTB-213ENST00000496055 SPDYE2BA6NHP3 402 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ATG7O95352 703 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SPDYE6P0CI01 402 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 GNAT2P19087 354 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 GUCY1B3Q02153 619 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 RCN1Q15293 331 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 UNC5DQ6UXZ4 953 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ERO1BQ86YB8 467 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PPM1EQ8WY54 764 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TCHPQ9BT92 498 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TSGA10Q9BZW7 698 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 ELP3Q9H9T3 547 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 NUCB2P80303 420 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGGTB-213ENST00000496055 COX10Q12887 443 aa5.15□□□□□ -1.59
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