RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
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SIMC1-208ENST00000495423 ZNF536O15090 1300 aa27.45■■□□□ 1.99
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SIMC1-208ENST00000495423 CXCL17Q6UXB2 119 aa27.45■■□□□ 1.98
SIMC1-208ENST00000495423 RNF146Q9NTX7 359 aa27.45■■□□□ 1.98
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SIMC1-208ENST00000495423 TMEM232C9JQI7 657 aa27.44■■□□□ 1.98
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SIMC1-208ENST00000495423 FAM160B2Q86V87 743 aa27.44■■□□□ 1.98
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SIMC1-208ENST00000495423 GMCL1Q96IK5 515 aa27.44■■□□□ 1.98
SIMC1-208ENST00000495423 ASB2Q96Q27 587 aa27.44■■□□□ 1.98
SIMC1-208ENST00000495423 HIPK3Q9H422 1215 aa27.44■■□□□ 1.98
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SIMC1-208ENST00000495423 TSPY8P0CW00 308 aa27.43■■□□□ 1.98
SIMC1-208ENST00000495423 ITGA7Q13683 1181 aa27.43■■□□□ 1.98
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SIMC1-208ENST00000495423 IFNL3Q8IZI9 196 aa27.43■■□□□ 1.98
SIMC1-208ENST00000495423 CHURC1Q8WUH1 139 aa27.43■■□□□ 1.98
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SIMC1-208ENST00000495423 PLA2G6O60733 806 aa27.42■■□□□ 1.98
SIMC1-208ENST00000495423 APPP05067 770 aa27.42■■□□□ 1.98
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SIMC1-208ENST00000495423 GPATCH3Q96I76 525 aa27.42■■□□□ 1.98
SIMC1-208ENST00000495423 AGBL1Q96MI9 1066 aa27.42■■□□□ 1.98
SIMC1-208ENST00000495423 PDE4BQ07343 736 aa27.41■■□□□ 1.98
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SIMC1-208ENST00000495423 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa27.41■■□□□ 1.98
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SIMC1-208ENST00000495423 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
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SIMC1-208ENST00000495423 COL9A1P20849 921 aa27.4■■□□□ 1.98
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SIMC1-208ENST00000495423 IQSEC1Q6DN90 963 aa27.4■■□□□ 1.98
SIMC1-208ENST00000495423 TRERF1Q96PN7 1200 aa27.4■■□□□ 1.98
SIMC1-208ENST00000495423 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa27.39■■□□□ 1.98
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SIMC1-208ENST00000495423 TAPT1Q6NXT6 567 aa27.39■■□□□ 1.98
SIMC1-208ENST00000495423 OTOP2Q7RTS6 562 aa27.39■■□□□ 1.98
SIMC1-208ENST00000495423 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa27.39■■□□□ 1.98
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SIMC1-208ENST00000495423 WNT8AQ9H1J5 351 aa27.39■■□□□ 1.98
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SIMC1-208ENST00000495423 PTGS1P23219 599 aa27.37■■□□□ 1.97
SIMC1-208ENST00000495423 CCL23P55773 120 aa27.37■■□□□ 1.97
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SIMC1-208ENST00000495423 VWCEQ96DN2 955 aa27.36■■□□□ 1.97
SIMC1-208ENST00000495423 VTA1Q9NP79 307 aa27.36■■□□□ 1.97
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SIMC1-208ENST00000495423 MUM1L1Q5H9M0 696 aa27.35■■□□□ 1.97
SIMC1-208ENST00000495423 RCSD1Q6JBY9 416 aa27.35■■□□□ 1.97
SIMC1-208ENST00000495423 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
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SIMC1-208ENST00000495423 PRR12Q9ULL5 1215 aa27.35■■□□□ 1.97
SIMC1-208ENST00000495423 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa27.35■■□□□ 1.97
SIMC1-208ENST00000495423 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa27.35■■□□□ 1.97
SIMC1-208ENST00000495423 IGHDP01880 384 aa27.34■■□□□ 1.97
SIMC1-208ENST00000495423 PSMC6P62333 389 aa27.34■■□□□ 1.97
SIMC1-208ENST00000495423 TMEM63BQ5T3F8 832 aa27.34■■□□□ 1.97
SIMC1-208ENST00000495423 KCTD1Q719H9 257 aa27.34■■□□□ 1.97
SIMC1-208ENST00000495423 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SIMC1-208ENST00000495423 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SIMC1-208ENST00000495423 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.97
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