RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 IQCEQ6IPM2 695 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 RCSD1Q6JBY9 416 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 KREMEN2Q8NCW0 462 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 MCMBPQ9BTE3 642 aa10.72□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 B4E1Z4 1266 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 OPA1O60313 960 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF205O95201 554 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 CYP4F3Q08477 520 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 TESK1Q15569 626 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 RNF180Q86T96 592 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 SPACA3Q8IXA5 215 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 PPIL6Q8IXY8 311 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 SLC12A9Q9BXP2 914 aa10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
PTPRC-212ENST00000491302 ZSWIM5Q9P217 1185 aa10.71□□□□□ -0.69
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PTPRC-212ENST00000491302 NPTXRO95502 500 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 SYPP08247 313 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 CPEP16870 476 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 IGFALSP35858 605 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 RASSF7Q02833 373 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 RNF111Q6ZNA4 994 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 USHBP1Q8N6Y0 703 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 FAM181AQ8N9Y4 354 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 NPLOC4Q8TAT6 608 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 FRS2Q8WU20 508 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 HSPA12BQ96MM6 686 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 GPRC5CQ9NQ84 441 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 TCFL5Q9UL49 500 aa10.7□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM265A0A087WTH1 108 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 H3BS24 57 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 IFNGR1P15260 489 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 FSTP19883 344 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 NFKB2Q00653 900 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 KCNAB2Q13303 367 aa10.69□□□□□ -0.7
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PTPRC-212ENST00000491302 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 NETO1Q8TDF5 533 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2FQ969M7 185 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 GPR27Q9NS67 375 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP13Q9UII6 198 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 MCM8Q9UJA3 840 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa10.69□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 CYP26A1O43174 497 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 GSTM1P09488 218 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 GAB4Q2WGN9 574 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 DENND5AQ6IQ26 1287 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 FGD2Q7Z6J4 655 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 IFNL3Q8IZI9 196 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 TRAF6Q9Y4K3 522 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 PAMP19021 973 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 LTKP29376 864 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 LTBRP36941 435 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 NEK4P51957 841 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 GPR85P60893 370 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 RBM10P98175 930 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 WWC2Q6AWC2 1192 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 SCLYQ96I15 445 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 PHF20Q9BVI0 1012 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 FOXP3Q9BZS1 431 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 PLAGL2Q9UPG8 496 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 CRTAMO95727 393 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 PLS3P13797 630 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 DIO2Q92813 273 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 MMP19Q99542 508 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA3GQ9NS98 782 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 PIM2Q9P1W9 311 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 U3KQE9 123 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 GUCY1A3Q02108 690 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 RTP2Q5QGT7 225 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 KCNT2Q6UVM3 1135 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 UBR7Q8N806 425 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC1BQ9P126 229 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 ASXL2Q76L83 1435 aa10.65□□□□□ -0.7
PTPRC-212ENST00000491302 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D8O95759 1140 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 CFAP100Q494V2 611 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 CYP2R1Q6VVX0 501 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRC-212ENST00000491302 CDADC1Q9BWV3 514 aa10.64□□□□□ -0.71
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