RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	SYT1	P21579	422 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	ADCY7	P51828	1080 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	HTRA3	P83110	453 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	KRT40	Q6A162	431 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	CHST13	Q8NET6	341 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZIC5	Q96T25	663 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	BTBD7	Q9P203	1132 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	FBXO40	Q9UH90	709 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	TLR2	O60603	784 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	CNMD	O75829	334 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	MMP1	P03956	469 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	DDIT3	P35638	169 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	FOSB	P53539	338 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	ERVK-9	P63128	1117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	ERVK-24	P63145	666 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	MCTP2	Q6DN12	878 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	CUL5	Q93034	780 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	RLF	Q13129	1914 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	POLR2M	P0CAP2	368 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	KRT2	P35908	639 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	GUCY1B3	Q02153	619 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602		Q3C1V9	767 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	MCTP1	Q6DN14	999 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	BLID	Q8IZY5	108 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	MROH8	Q9H579	483 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	ACAD9	Q9H845	621 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	RNF146	Q9NTX7	359 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	MTMR6	Q9Y217	621 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	MYH6	P13533	1939 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	PARP14	Q460N5	1801 aa		10.77	□□□□□ -0.68
SH3BP4-208	ENST00000462602	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	BRD1	O95696	1058 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	BCR	P11274	1271 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	ERCC3	P19447	782 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	CRHR2	Q13324	411 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	C17orf99	Q6UX52	265 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	SHISA4	Q96DD7	197 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	CPA4	Q9UI42	421 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	RIPK3	Q9Y572	518 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	BTBD18	B2RXH4	712 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	CFB	P00751	764 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	MAPK4	P31152	587 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	HSD17B4	P51659	736 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	GHRHR	Q02643	423 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	AP3B2	Q13367	1082 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	NPY5R	Q15761	445 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	BRAP	Q7Z569	592 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	RNF186	Q9NXI6	227 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	PFAS	O15067	1338 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		10.75	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms