RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPATQ06203 517 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNFAIP1Q13829 316 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TLR1Q15399 786 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NFE2L2Q16236 605 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ITPKCQ96DU7 683 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CFAP53Q96M91 514 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASB2Q96Q27 587 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYD88Q99836 296 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUDCQ9Y266 331 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYH13Q9UKX3 1938 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CAPN2P17655 700 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLN3Q13286 438 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BIRC2Q13490 618 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRIK5Q16478 980 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q6ZVU0 165 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIB2Q92519 343 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCYL1Q96KG9 808 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLEKHF1Q96S99 279 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EPHX3Q9H6B9 360 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STIM2Q9P246 746 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 THEGQ9P2T0 379 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP34Q70CQ2 3546 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CFAP54Q96N23 3096 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRANK1O15050 2925 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NDUFB5O43674 189 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAF5LO75529 589 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CENPCQ03188 943 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CBLBQ13191 982 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TEAD4Q15561 434 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMC7Q7Z402 723 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYO19Q96H55 970 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SERTM1A2A2V5 107 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EML1O00423 815 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IL1R1P14778 569 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HSD3B2P26439 372 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPP2R1AP30153 589 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTGIRP43119 386 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CRKP46108 304 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNJ4P48050 445 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNNI2P48788 182 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRE11P49959 708 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHRNDQ07001 517 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF787Q6DD87 383 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MEIOBQ8N635 442 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CITED4Q96RK1 184 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SWAP70Q9UH65 585 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ST8SIA5O15466 376 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FZD6O60353 706 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BDNFP23560 247 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOS2P35228 1153 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms