RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 SARM1Q6SZW1 724 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 CATIPQ7Z7H3 387 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 LCORLQ8N3X6 602 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC00301Q8NCQ3 95 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 TIGD1Q96MW7 591 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 NBPF3Q9H094 633 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 CBX8Q9HC52 389 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 SMTNL1A8MU46 457 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 CUTAO60888 179 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLA2G5P39877 138 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 PDE4BQ07343 736 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 DSG2Q14126 1118 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT40Q6A162 431 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 CYB5R4Q7L1T6 521 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 C11orf49Q9H6J7 331 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 DACH1Q9UI36 760 aa7.22□□□□□ -1.25
SHQ1P1-201ENST00000437111 MUC3AQ02505 3323 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 PFASO15067 1338 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 TNKSO95271 1327 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 CMA1P23946 247 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 KIF5BP33176 963 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 GSDMDP57764 484 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLC39A14Q15043 492 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 GRIK5Q16478 980 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 KANK3Q6NY19 840 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 MIGA2Q7L4E1 593 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 LUZP1Q86V48 1076 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 SLF2Q8IX21 1173 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 MIGA1Q8NAN2 632 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDR66Q8TBY9 1149 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF341Q9BYN7 854 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCDHA7Q9UN72 937 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 TNFRSF10AO00220 468 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 ORC4O43929 436 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 BAG3O95817 575 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 MMP1P03956 469 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 LDHCP07864 332 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYKP43405 635 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 GYG1P46976 350 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF75DP51815 510 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 TRIM32Q13049 653 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 DCAF15Q66K64 600 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM83AQ86UY5 434 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 PLA2G4DQ86XP0 818 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 ENGASEQ8NFI3 743 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 FAM122AQ96E09 287 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 HOOK2Q96ED9 719 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 WDR70Q9NW82 654 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 CLIP2Q9UDT6 1046 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 ZNF112Q9UJU3 913 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 CXCL11O14625 94 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 CBFA2T2O43439 604 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 PFKFB1P16118 471 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDC27P30260 824 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRT2P35908 639 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms