RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	FBXL16	Q8N461	479 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	DNER	Q8NFT8	737 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		12.81	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIM32	Q13049	653 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	KLRF2	D3W0D1	207 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	AKR1A1	P14550	325 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC16A2	P36021	539 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	FBXO11	Q86XK2	927 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	MTMR7	Q9Y216	660 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	LHX8	Q68G74	356 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	AMN	Q9BXJ7	453 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	DNM1L	O00429	736 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	ZBTB5	O15062	677 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	NKX3-2	P78367	333 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	TROAP	Q12815	778 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	VTA1	Q9NP79	307 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	NID2	Q14112	1375 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	PGK2	P07205	417 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP2C19	P33261	490 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	TRPV1	Q8NER1	839 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160		Q9Y3F1	56 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		12.78	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		12.77	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	RARB	P10826	455 aa		12.77	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	ARMCX2	Q7L311	632 aa		12.77	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	FGD4	Q96M96	766 aa		12.77	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		12.77	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		12.77	□□□□□ -0.36
UBXN7-205	ENST00000429160	KBTBD13	C9JR72	458 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	IWS1	Q96ST2	819 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	CNGA1	P29973	690 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC4A3	P48751	1232 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	ACVR2B	Q13705	512 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	SKAP1	Q86WV1	359 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	COL6A1	P12109	1028 aa		12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	SPC25	Q9HBM1	224 aa		12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	NSMF	Q6X4W1	530 aa		12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	RNF180	Q86T96	592 aa		12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		12.76	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	ANAPC15	P60006	121 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	SNAP25	P60880	206 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	ALPK3	Q96L96	1907 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	EDNRB	P24530	442 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	HSD17B4	P51659	736 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	IL27	Q8NEV9	243 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	IL17RA	Q96F46	866 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	KATNBL1	Q9H079	304 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	PHF24	Q9UPV7	400 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBXN7-205	ENST00000429160	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		12.75	□□□□□ -0.37

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