RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 QRICH1Q2TAL8 776 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NSMFQ6X4W1 530 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF654Q8IZM8 581 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PNMA2Q9UL42 364 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ASTN1O14525 1302 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PFASO15067 1338 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LIFRP42702 1097 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USH1GQ495M9 461 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUP133Q8WUM0 1156 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTMR8Q96EF0 704 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TCEANC2Q96MN5 208 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNX14Q9Y5W7 946 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEPT4O43236 478 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDAH1O94760 285 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KRT32Q14532 448 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMTC2Q8N394 836 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NRBP1Q9UHY1 535 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYTH3O43739 400 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKLE1Q8NAG6 615 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RIOX1Q9H6W3 641 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC69A6NI79 296 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANO1Q5XXA6 986 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC30A10Q6XR72 485 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NFXL1Q6ZNB6 911 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAP3K14Q99558 947 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MSCO60682 206 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARMCX2Q7L311 632 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SGMS1Q86VZ5 419 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP26Q9BXU7 913 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTPDC1A2A3K4 754 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZBTB5O15062 677 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CPA1P15085 419 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RXRAP19793 462 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBXO11Q86XK2 927 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIGSQ96S52 555 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KATNBL1Q9H079 304 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CNPY2Q9Y2B0 182 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABCB11O95342 1321 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF207Q6ZRF8 634 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBC1D5Q92609 795 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC12A7Q9Y666 1083 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LCTP09848 1927 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CALML3P27482 149 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPS6P62753 249 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACVR2BQ13705 512 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RGS22Q8NE09 1264 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BRPF3Q9ULD4 1205 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NECAB2Q7Z6G3 386 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOMER1Q86YM7 354 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AMNQ9BXJ7 453 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FRMPD3Q5JV73 1810 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OPLAHO14841 1288 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLEKHA8P1O95397 391 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIF5BP33176 963 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ASB14A6NK59 587 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL6A1P12109 1028 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AKR1A1P14550 325 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MORC4Q8TE76 937 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPZ1Q9BXG8 430 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa29■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADCY6O43306 1168 aa29■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CALM1P0DP23 149 aa29■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CALM2P0DP24 149 aa29■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CALM3P0DP25 149 aa29■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 APOA5Q6Q788 366 aa29■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MICU3Q86XE3 530 aa29■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FANCBQ8NB91 859 aa29■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C11orf49Q9H6J7 331 aa29■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa29■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RARBP10826 455 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMARCA1P28370 1054 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PIBF1Q8WXW3 757 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL20A1Q9P218 1284 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms