RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC69A6NI79 296 aa29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CAPN2P17655 700 aa29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CLEC4DQ8WXI8 215 aa29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 TCEANC2Q96MN5 208 aa29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR19Q8NEZ3 1342 aa29.12■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPDC1A2A3K4 754 aa29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 KRT32Q14532 448 aa29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 TMTC2Q8N394 836 aa29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CNPY2Q9Y2B0 182 aa29.11■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 MYH6P13533 1939 aa29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 MCM3APO60318 1980 aa29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SEPT4O43236 478 aa29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 HSPA4P34932 840 aa29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO11Q86XK2 927 aa29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 MSCO60682 206 aa29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 LIFRP42702 1097 aa29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC35G1Q2M3R5 365 aa29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ANKLE1Q8NAG6 615 aa29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 NRBP1Q9UHY1 535 aa29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SNX14Q9Y5W7 946 aa29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CPA1P15085 419 aa29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 RXRAP19793 462 aa29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CALML3P27482 149 aa29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF207Q6ZRF8 634 aa29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ARMCX2Q7L311 632 aa29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 HOMER1Q86YM7 354 aa29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 KCNB2Q92953 911 aa29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1-202ENST00000425695 DDAH1O94760 285 aa29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC30A10Q6XR72 485 aa29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 NECAB2Q7Z6G3 386 aa29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 PIBF1Q8WXW3 757 aa29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 PIGSQ96S52 555 aa29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC12A7Q9Y666 1083 aa29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ASTN1O14525 1302 aa29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCB11O95342 1321 aa29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 TBC1D5Q92609 795 aa29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 DPF3Q92784 378 aa29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 MTMR8Q96EF0 704 aa29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 RIOX1Q9H6W3 641 aa29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 FRMPD3Q5JV73 1810 aa29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB5O15062 677 aa29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 CYTH3O43739 400 aa29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF5BP33176 963 aa29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 RPS6P62753 249 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ACVR2BQ13705 512 aa29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP3K14Q99558 947 aa29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 AMNQ9BXJ7 453 aa29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 USP26Q9BXU7 913 aa29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ASB14A6NK59 587 aa29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 C11orf49Q9H6J7 331 aa29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 LCTP09848 1927 aa29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa29.03■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 SGMS1Q86VZ5 419 aa29.03■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 HTATIP2Q9BUP3 242 aa29.03■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM184BQ9ULE4 1060 aa29.03■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 CALM1P0DP23 149 aa29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 CALM2P0DP24 149 aa29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 CALM3P0DP25 149 aa29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 RARBP10826 455 aa29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 AKR1A1P14550 325 aa29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 FGD1P98174 961 aa29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 MICU3Q86XE3 530 aa29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHA8P1O95397 391 aa29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC144BQ3MJ40 725 aa29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1-202ENST00000425695 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1-202ENST00000425695 EEPD1Q7L9B9 569 aa29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1-202ENST00000425695 ARRDC4Q8NCT1 418 aa29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1-202ENST00000425695 RGS22Q8NE09 1264 aa29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1-202ENST00000425695 BRPF3Q9ULD4 1205 aa29.01■■■□□ 2.23
HTATSF1-202ENST00000425695 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa29■■■□□ 2.23
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