RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424263.6

PRDM11-201, Transcript of PR/SET domain 11, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene PRDM11, Length 1,858 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM11-201ENST00000424263 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 PORCNQ9H237 461 aa23■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 ABCB11O95342 1321 aa22.99■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 SLC25A27O95847 323 aa22.99■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 ALAS1P13196 640 aa22.99■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 COPB2P35606 906 aa22.99■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 TKFCQ3LXA3 575 aa22.99■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 COA7Q96BR5 231 aa22.99■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 AIFM3Q96NN9 605 aa22.99■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 BARHL2Q9NY43 387 aa22.99■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 STXBP3O00186 592 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 ERCC3P19447 782 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 TRAF1Q13077 416 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 SHISA4Q96DD7 197 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 RNF146Q9NTX7 359 aa22.98■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 OPLAHO14841 1288 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 CHST13Q8NET6 341 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 WASF1Q92558 559 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 EFCC1Q9HA90 598 aa22.97■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 GPR25O00155 361 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 MROH8Q9H579 483 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 ACAD9Q9H845 621 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 TSKSQ9UJT2 592 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 NFIBO00712 420 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 GJB2P29033 226 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 ALG1Q9BT22 464 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.96■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PRDM11-201ENST00000424263 MAPK4P31152 587 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 NAPAP54920 295 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 SP3Q02447 781 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 FBXO40Q9UH90 709 aa22.95■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 CTGFP29279 349 aa22.94■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.94■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 ESYT2A0FGR8 921 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 GHRHRQ02643 423 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 GPR142Q7Z601 462 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.93■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 MCM3APO60318 1980 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 DDIT3P35638 169 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 CAP1Q01518 475 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 WDR78Q5VTH9 848 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 KIF3AQ9Y496 699 aa22.92■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.91■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.91■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.91■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 RGS22Q8NE09 1264 aa22.91■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 FKTNO75072 461 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 XBP1P17861 261 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 NPY5RQ15761 445 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 TRIM47Q96LD4 638 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 MMP19Q99542 508 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 MAF1Q9H063 256 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 PFASO15067 1338 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 SMCO2A6NFE2 343 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 FOXN1O15353 648 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 FCER1AP12319 257 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 PTPREP23469 700 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 PSMC4P43686 418 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 HSD17B4P51659 736 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 ADCY7P51828 1080 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 FOSBP53539 338 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 FCGRTP55899 365 aa22.9■■□□□ 1.26
PRDM11-201ENST00000424263 GRB14Q14449 540 aa22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms