RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 NFIBO00712 420 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 LIFRP42702 1097 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT32Q14532 448 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 USH1GQ495M9 461 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 ANO1Q5XXA6 986 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNB2Q92953 911 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC69A6NI79 296 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 HSPA4P34932 840 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP3K14Q99558 947 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ARMCX2Q7L311 632 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO11Q86XK2 927 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 DPF3Q92784 378 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 MYL10Q9BUA6 226 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ASB14A6NK59 587 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 DDAH1O94760 285 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ACVR2BQ13705 512 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 RGS22Q8NE09 1264 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 MTMR8Q96EF0 704 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf49Q9H6J7 331 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB5O15062 677 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CALML3P27482 149 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ARRDC4Q8NCT1 418 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 AMNQ9BXJ7 453 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCB11O95342 1321 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CYTH3O43739 400 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF5BP33176 963 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D5Q92609 795 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ASTN1O14525 1302 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CALM1P0DP23 149 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CALM2P0DP24 149 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CALM3P0DP25 149 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 RARBP10826 455 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 AKR1A1P14550 325 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 PIGSQ96S52 555 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 USP26Q9BXU7 913 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 HOMER1Q86YM7 354 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 MAF1Q9H063 256 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 DNM1LO00429 736 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 COL6A1P12109 1028 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 RXRAP19793 462 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SMARCA1P28370 1054 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 GNAQP50148 359 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 KATNBL1Q9H079 304 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CPA1P15085 419 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC144BQ3MJ40 725 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 FANCBQ8NB91 859 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 MORC4Q8TE76 937 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 PGK1P00558 417 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAF1Q13077 416 aa24.48■■□□□ 1.51
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