RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 PTGS1P23219 599 aa22.89■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 CYP2C18P33260 490 aa22.89■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.89■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM240Q5SV17 173 aa22.89■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 FAM126BQ8IXS8 530 aa22.89■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 KATNBL1Q9H079 304 aa22.89■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 MX1P20591 662 aa22.88■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 PBX2P40425 430 aa22.88■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 TKFCQ3LXA3 575 aa22.88■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.88■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF365Q70YC5 407 aa22.88■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.88■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.88■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.88■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 MCM3APO60318 1980 aa22.87■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 VCANP13611 3396 aa22.87■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.87■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.87■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.87■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.87■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 ASTN1O14525 1302 aa22.86■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 CTAGE5O15320 804 aa22.86■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 ZEB2O60315 1214 aa22.86■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 SMPD1P17405 629 aa22.86■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 PBX4Q9BYU1 374 aa22.86■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 CCL23P55773 120 aa22.85■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 ITGA7Q13683 1181 aa22.85■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 USP38Q8NB14 1042 aa22.85■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 HIPK3Q9H422 1215 aa22.85■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.85■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.85■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 SLC16A2P36021 539 aa22.84■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 PSMC6P62333 389 aa22.84■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 VPS53Q5VIR6 699 aa22.84■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.84■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.84■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 IL23AQ9NPF7 189 aa22.84■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 MSRAQ9UJ68 235 aa22.84■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.83■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 CABYRO75952 493 aa22.83■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 CD4P01730 458 aa22.83■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.83■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.83■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.83■■□□□ 1.25
UBXN4-202ENST00000415164 FOXP2O15409 715 aa22.82■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 PLA2G6O60733 806 aa22.82■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 FGBP02675 491 aa22.82■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.82■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.82■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.82■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 DCAF4Q8WV16 495 aa22.82■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.81■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 ICAM1P05362 532 aa22.81■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 IGFBP4P22692 258 aa22.81■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.81■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.81■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.81■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.81■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 ZBBXA8MT70 800 aa22.8■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 B4GALT4O60513 344 aa22.8■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.8■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 VTA1Q9NP79 307 aa22.8■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 MYL3P08590 195 aa22.79■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 CALML3P27482 149 aa22.79■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 NKX3-2P78367 333 aa22.79■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 RAB30Q15771 203 aa22.79■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 RASIP1Q5U651 963 aa22.79■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.79■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 HERVK_113Q902F9 699 aa22.79■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 EVI5LQ96CN4 794 aa22.79■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 GRIN2DO15399 1336 aa22.79■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 NFIBO00712 420 aa22.78■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.78■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 SCLYQ96I15 445 aa22.78■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.78■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 ORC4O43929 436 aa22.77■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 HAND2P61296 217 aa22.77■■□□□ 1.24
UBXN4-202ENST00000415164 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.77■■□□□ 1.24
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