RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.75■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 RAB34Q9BZG1 259 aa22.75■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.74■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 RHOBTB3O94955 611 aa22.74■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 PDIA5Q14554 519 aa22.74■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.74■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.74■■□□□ 1.23
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SUMO3-204ENST00000411651 GMCL1Q96IK5 515 aa22.74■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.74■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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SUMO3-204ENST00000411651 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
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SUMO3-204ENST00000411651 TTLL6Q8N841 843 aa22.73■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.73■■□□□ 1.23
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SUMO3-204ENST00000411651 YDJCA8MPS7 323 aa22.72■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 SLC26A4O43511 780 aa22.72■■□□□ 1.23
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SUMO3-204ENST00000411651 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.72■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 STAMQ92783 540 aa22.72■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.72■■□□□ 1.23
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SUMO3-204ENST00000411651 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.72■■□□□ 1.23
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SUMO3-204ENST00000411651 SLC1A4P43007 532 aa22.72■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 CACNB3P54284 484 aa22.72■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 SLFN13Q68D06 897 aa22.72■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.72■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 ADSSL1Q8N142 457 aa22.72■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 CALML4Q96GE6 196 aa22.72■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.72■■□□□ 1.23
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SUMO3-204ENST00000411651 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.71■■□□□ 1.23
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SUMO3-204ENST00000411651 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM260Q9NX78 707 aa22.71■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.71■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 USP17L10C9JJH3 530 aa22.7■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 H7C1D1 291 aa22.7■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 STX10O60499 249 aa22.7■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
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SUMO3-204ENST00000411651 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.7■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 CEP135Q66GS9 1140 aa22.7■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 KCTD1Q719H9 257 aa22.7■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.7■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.7■■□□□ 1.23
SUMO3-204ENST00000411651 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.7■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 EDIL3O43854 480 aa22.7■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 POTEAQ6S8J7 498 aa22.7■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.7■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.7■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 NELFBQ8WX92 580 aa22.7■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 GMLQ99445 158 aa22.7■■□□□ 1.22
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SUMO3-204ENST00000411651 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.7■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.69■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 USP27XA6NNY8 438 aa22.69■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 C21orf2O43822 256 aa22.69■■□□□ 1.22
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SUMO3-204ENST00000411651 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.69■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.69■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM139Q8IV31 216 aa22.69■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM9Q9C026 710 aa22.69■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 TECP42680 631 aa22.69■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 STX17P56962 302 aa22.69■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 SEPT2Q15019 361 aa22.69■■□□□ 1.22
SUMO3-204ENST00000411651 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.69■■□□□ 1.22
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