RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 GRIN1Q05586 938 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 TREML2Q5T2D2 321 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 ERO1BQ86YB8 467 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 CLIC6Q96NY7 704 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 MCM7P33993 719 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 BICD2Q8TD16 824 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 OPTNQ96CV9 577 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 ATG4CQ96DT6 458 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa23.02■■□□□ 1.28
ODC1-202ENST00000405333 MEIS2O14770 477 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 PPATQ06203 517 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 CPXCR1Q8N123 301 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.01■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 EDIL3O43854 480 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 GJA5P36382 358 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 TBCKQ8TEA7 893 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 TBC1D5Q92609 795 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 PPP6R2O75170 966 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 TRAPPC10P48553 1259 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 ADALQ6DHV7 355 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.99■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 VWA5AO00534 786 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 NR1I2O75469 434 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 ICAM1P05362 532 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 PTGDRQ13258 359 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 LETM2Q2VYF4 491 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 SPECC1Q5M775 1068 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 CCPG1Q9ULG6 757 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.98■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 A0A1B0GVL5 298 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 PEX10O60683 326 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 CST9Q5W186 159 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 SHC4Q6S5L8 630 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 FSIP1Q8NA03 581 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 DACT1Q9NYF0 836 aa22.97■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 PPIL2Q13356 520 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 NEK8Q86SG6 692 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 CFBP00751 764 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 DSG3P32926 999 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 COG2Q14746 738 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.96■■□□□ 1.27
ODC1-202ENST00000405333 NFIBO00712 420 aa22.95■■□□□ 1.26
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ODC1-202ENST00000405333 PTPREP23469 700 aa22.95■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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ODC1-202ENST00000405333 MOGSQ13724 837 aa22.95■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 JMYQ8N9B5 988 aa22.95■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 REPS2Q8NFH8 660 aa22.95■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.95■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 A0A1W2PQ27 194 aa22.94■■□□□ 1.26
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ODC1-202ENST00000405333 A0A1W2PQD8 194 aa22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 ALAS1P13196 640 aa22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 NDUFA8P51970 172 aa22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 IL17AQ16552 155 aa22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 RIPK3Q9Y572 518 aa22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 CXCL11O14625 94 aa22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 TDP2O95551 362 aa22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 CHADLQ6NUI6 762 aa22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 ANO3Q9BYT9 981 aa22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ODC1-202ENST00000405333 ABCB11O95342 1321 aa22.93■■□□□ 1.26
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