RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 SEMA3EO15041 775 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 CIAO1O76071 339 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 CNKSR1Q969H4 720 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 TRIM37O94972 964 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 MIPOL1Q8TD10 442 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 GPT2Q8TD30 523 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 FAM170AA1A519 330 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 PPP4R1Q8TF05 950 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 ANO3Q9BYT9 981 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 CUEDC2Q9H467 287 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 BCS1LQ9Y276 419 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 TRAPPC10P48553 1259 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 SCRN1Q12765 414 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 RNF169Q8NCN4 708 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 LAD1O00515 517 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 VPS41P49754 854 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 POLA2Q14181 598 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 AMNQ9BXJ7 453 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 EFCAB8A8MWE9 144 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 MYOM2P54296 1465 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 CCDC38Q502W7 563 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 GSDMAQ96QA5 445 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 CLIC4Q9Y696 253 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 BIRC2Q13490 618 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 RPS6KA2Q15349 733 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP25-204ENST00000400183 TMOD1P28289 359 aa20.27■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 PKP1Q13835 747 aa20.27■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.27■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.835e-7■■■■□ 21.1
USP25-204ENST00000400183 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.27■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 EXOC3L4Q17RC7 722 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 GJA10Q969M2 543 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 RNF8O76064 485 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 CYP4A11Q02928 519 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 SIK1P57059 783 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 BBOF1Q8ND07 529 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 DPH5Q9H2P9 285 aa20.26■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 SLC39A14Q15043 492 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ODR4Q5SWX8 454 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 TXNDC9O14530 226 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 XDHP47989 1333 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 BPIFB4P59827 614 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 GNGT1P63211 74 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 THAP12O43422 761 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 APOA5Q6Q788 366 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 PPP6R2O75170 966 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 BFSP1Q12934 665 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 ADORA1P30542 326 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 PTPROQ16827 1216 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20.24■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 CNGA1P29973 690 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 PTK2Q05397 1052 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.23■□□□□ 0.83
USP25-204ENST00000400183 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms