RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
GNPTAB-202ENST00000392919 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD35Q8N283 1001 aa31.71■■■□□ 2.67
GNPTAB-202ENST00000392919 CHST13Q8NET6 341 aa31.71■■■□□ 2.67
GNPTAB-202ENST00000392919 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
GNPTAB-202ENST00000392919 FGD4Q96M96 766 aa31.71■■■□□ 2.67
GNPTAB-202ENST00000392919 PRR12Q9ULL5 1215 aa31.71■■■□□ 2.67
GNPTAB-202ENST00000392919 FDX1P10109 184 aa31.7■■■□□ 2.67
GNPTAB-202ENST00000392919 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC41Q15345 812 aa31.7■■■□□ 2.67
GNPTAB-202ENST00000392919 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
GNPTAB-202ENST00000392919 FBXO40Q9UH90 709 aa31.7■■■□□ 2.67
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR19Q8NEZ3 1342 aa31.7■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 GOLGA8HP0CJ92 632 aa31.69■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC16A2P36021 539 aa31.69■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC174Q6PII3 467 aa31.69■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa31.69■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 TCEANC2Q96MN5 208 aa31.69■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 CNPY2Q9Y2B0 182 aa31.69■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 KBTBD13C9JR72 458 aa31.68■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 CPA1P15085 419 aa31.68■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 LIFRP42702 1097 aa31.68■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa31.68■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 RNF146Q9NTX7 359 aa31.68■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 PGK1P00558 417 aa31.67■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 RARBP10826 455 aa31.67■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 ADCYAP1R1P41586 468 aa31.67■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 TROAPQ12815 778 aa31.67■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 SYDE2Q5VT97 1194 aa31.67■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 FERMT2Q96AC1 680 aa31.67■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 ACAD9Q9H845 621 aa31.67■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa31.67■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 BMP8BP34820 402 aa31.66■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 RTP1P59025 263 aa31.66■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 CNTN2Q02246 1040 aa31.66■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 ASPRV1Q53RT3 343 aa31.66■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 TMTC2Q8N394 836 aa31.66■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 MCM3APO60318 1980 aa31.66■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A1W2PPC1 479 aa31.65■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 ALAS1P13196 640 aa31.65■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 AKR1A1P14550 325 aa31.65■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa31.65■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa31.65■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 CATIPQ7Z7H3 387 aa31.65■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 TRERF1Q96PN7 1200 aa31.65■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 UBA5Q9GZZ9 404 aa31.65■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 CPVLQ9H3G5 476 aa31.65■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 PSMA5P28066 241 aa31.64■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 GRM4Q14833 912 aa31.64■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 MUM1L1Q5H9M0 696 aa31.64■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF654Q8IZM8 581 aa31.64■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 STAG2Q8N3U4 1231 aa31.64■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 MAD2L2Q9UI95 211 aa31.64■■■□□ 2.66
GNPTAB-202ENST00000392919 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 CASTP20810 708 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 RPS6KB1P23443 525 aa31.63■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 NFXL1Q6ZNB6 911 aa31.63■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 SGMS1Q86VZ5 419 aa31.63■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM133AQ8N9E0 248 aa31.63■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa31.63■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 ARMCX2Q7L311 632 aa31.62■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 MYL10Q9BUA6 226 aa31.62■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 TM6SF1Q9BZW5 370 aa31.62■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa31.62■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 SOWAHBA6NEL2 793 aa31.61■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC69A6NI79 296 aa31.61■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 POTEB2H3BUK9 544 aa31.61■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 ADCY6O43306 1168 aa31.61■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 ADAMTS4O75173 837 aa31.61■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 DDAH1O94760 285 aa31.61■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 ACVR2BQ13705 512 aa31.61■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 TKFCQ3LXA3 575 aa31.61■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa31.61■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM184BQ9ULE4 1060 aa31.61■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 CCPG1Q9ULG6 757 aa31.61■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 PHF24Q9UPV7 400 aa31.61■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM60Q495X7 471 aa31.6■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 RNF180Q86T96 592 aa31.6■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 NUP133Q8WUM0 1156 aa31.6■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 MAP3K14Q99558 947 aa31.6■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa31.59■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 KLRF2D3W0D1 207 aa31.59■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 ICAM1P05362 532 aa31.59■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 ANAPC15P60006 121 aa31.59■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 SNX17Q15036 470 aa31.59■■■□□ 2.65
GNPTAB-202ENST00000392919 Q6ZUG5 572 aa31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms