RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 B4DLN1 442 aa28.36■■■□□ 2.13
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C9orf40-201ENST00000376854 DNM2P50570 870 aa28.36■■■□□ 2.13
C9orf40-201ENST00000376854 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa28.36■■■□□ 2.13
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C9orf40-201ENST00000376854 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP28.32■■■□□ 2.12
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C9orf40-201ENST00000376854 TECP42680 631 aa28.29■■■□□ 2.12
C9orf40-201ENST00000376854 CDK8P49336 464 aa28.29■■■□□ 2.12
C9orf40-201ENST00000376854 KLK7P49862 253 aa28.29■■■□□ 2.12
C9orf40-201ENST00000376854 USP17L2Q6R6M4 530 aa28.29■■■□□ 2.12
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C9orf40-201ENST00000376854 KIAA1328Q86T90 577 aa28.29■■■□□ 2.12
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