RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373793.3

GGTA1P-201, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1 pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GGTA1P, Length 1,544 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 SAGE1Q9NXZ1 904 aa30.57■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 VPS54Q9P1Q0 977 aa30.57■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 ABCB11O95342 1321 aa30.56■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 STXBP3O00186 592 aa30.56■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 NAPAP54920 295 aa30.56■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 NCAPG2Q86XI2 1143 aa30.56■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 TRERF1Q96PN7 1200 aa30.56■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 RNF146Q9NTX7 359 aa30.56■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 SLC25A27O95847 323 aa30.55■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 ERCC3P19447 782 aa30.55■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 FOSBP53539 338 aa30.55■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 TYW1BQ6NUM6 668 aa30.55■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 KIF3AQ9Y496 699 aa30.55■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 TKFCQ3LXA3 575 aa30.54■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 PORCNQ9H237 461 aa30.54■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 WBP1LQ9NX94 342 aa30.54■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 COPB2P35606 906 aa30.53■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 MUM1L1Q5H9M0 696 aa30.53■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 WDR78Q5VTH9 848 aa30.53■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 EFCC1Q9HA90 598 aa30.53■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 GJB4Q9NTQ9 266 aa30.53■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 XBP1P17861 261 aa30.52■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 SHCBP1Q8NEM2 672 aa30.52■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 CHST13Q8NET6 341 aa30.52■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 SHISA4Q96DD7 197 aa30.52■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 SH3GLB2Q9NR46 395 aa30.52■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 PPP1R18Q6NYC8 613 aa30.52■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 CCDC148Q8NFR7 591 aa30.52■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 CLEC4DQ8WXI8 215 aa30.52■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 MROH8Q9H579 483 aa30.52■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 ACAD9Q9H845 621 aa30.52■■■□□ 2.48
GGTA1P-201ENST00000373793 NFIBO00712 420 aa30.51■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 C8orf76Q96K31 380 aa30.51■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 FBXO40Q9UH90 709 aa30.51■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 TRIM29Q14134 588 aa30.5■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 TSKSQ9UJT2 592 aa30.5■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 SMCO2A6NFE2 343 aa30.49■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 NLRP5P59047 1200 aa30.49■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 KCNJ14Q9UNX9 436 aa30.49■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 OPLAHO14841 1288 aa30.48■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 MAPK4P31152 587 aa30.48■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 SP3Q02447 781 aa30.48■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 JMYQ8N9B5 988 aa30.48■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 PSTPIP2Q9H939 334 aa30.48■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 MGAMO43451 1857 aa30.48■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 GPR25O00155 361 aa30.47■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 GUCY1B3Q02153 619 aa30.47■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 NSMFQ6X4W1 530 aa30.47■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 MCF2L2Q86YR7 1114 aa30.47■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 ZMYND12Q9H0C1 365 aa30.47■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 PLXNB2O15031 1838 aa30.47■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 ESYT2A0FGR8 921 aa30.47■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 CFBP00751 764 aa30.47■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 ADCY7P51828 1080 aa30.47■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 KRT40Q6A162 431 aa30.47■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 TBC1D5Q92609 795 aa30.47■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 CUL5Q93034 780 aa30.47■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 C6orf50Q9HD87 102 aa30.47■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 DOCK3Q8IZD9 2030 aa30.46■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 GPR142Q7Z601 462 aa30.46■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 ANKRD35Q8N283 1001 aa30.46■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 PHF20Q9BVI0 1012 aa30.46■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 RIC8AQ9NPQ8 531 aa30.46■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa30.46■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 PDCP20941 246 aa30.45■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 GNA11P29992 359 aa30.45■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 RNF207Q6ZRF8 634 aa30.45■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa30.45■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 MMP19Q99542 508 aa30.45■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
GGTA1P-201ENST00000373793 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa30.44■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 FCER1AP12319 257 aa30.44■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 CALML3P27482 149 aa30.44■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 PLEKHH3Q7Z736 793 aa30.44■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 H3BQV1 296 aa30.43■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 KCTD2Q14681 263 aa30.43■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 IFFO2Q5TF58 517 aa30.43■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 USP17L6PQ6QN14 398 aa30.43■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 RGS22Q8NE09 1264 aa30.43■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa30.43■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 GLT8D2Q9H1C3 349 aa30.43■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 PCDHA4Q9UN74 947 aa30.43■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 MMP1P03956 469 aa30.42■■■□□ 2.46
GGTA1P-201ENST00000373793 POLR2MP0CAP2 368 aa30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms