RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 HIPK3Q9H422 1215 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACAD9Q9H845 621 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRDM1O75626 825 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 APPP05067 770 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLFN13Q68D06 897 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 ASB14A6NK59 587 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADGRE1Q14246 886 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL27Q8NEV9 243 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM232C9JQI7 657 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZEB2O60315 1214 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 STAT2P52630 851 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 ITGA7Q13683 1181 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 TLK2Q86UE8 772 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
TRAPPC3-204ENST00000373166 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 TSPY3P0CV98 308 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 TSPY8P0CW00 308 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 TKFCQ3LXA3 575 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM160B2Q86V87 743 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 RNF146Q9NTX7 359 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 ASTN1O14525 1302 aa22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCL23P55773 120 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 PDE4BQ07343 736 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 TICAM2Q86XR7 235 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 RILPL2Q969X0 211 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 GMCL1Q96IK5 515 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 NAPBQ9H115 298 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 GRIN2DO15399 1336 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC1A4P43007 532 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 Q9Y3F1 56 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF536O15090 1300 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 B4GALT4O60513 344 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 ALAS1P13196 640 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMPD1P17405 629 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 TFAP4Q01664 338 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 PLA2G6O60733 806 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 MCCP23508 829 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC3-204ENST00000373166 RABGGTBP53611 331 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 PSMC6P62333 389 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM227BQ96M60 508 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP39A1Q9NYL5 469 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 A0A0D9SFI3 127 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBBXA8MT70 800 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC3-204ENST00000373166 VTA1Q9NP79 307 aa22.63■■□□□ 1.21
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