RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 SPAG1Q07617 926 aa26.84■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 RWDD2AQ9UIY3 292 aa26.84■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 GPS2Q13227 327 aa26.83■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 PICALMQ13492 652 aa26.83■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT31Q15323 416 aa26.83■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa26.83■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa26.83■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB21Q9UL25 225 aa26.83■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.83■■□□□ 1.89
AMIGO1-201ENST00000369862 TRIM14Q14142 442 aa26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 CERS5Q8N5B7 392 aa26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 MSANTD4Q8NCY6 345 aa26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 PIGSQ96S52 555 aa26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 VAT1LQ9HCJ6 419 aa26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 SMCO2A6NFE2 343 aa26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 F8W031 263 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC15Q8TF66 581 aa26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 ABHD10Q9NUJ1 306 aa26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 MYO1AQ9UBC5 1043 aa26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 GDAQ9Y2T3 454 aa26.82■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 N4BP3O15049 544 aa26.81■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 GABPAQ06546 454 aa26.81■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 TMC4Q7Z404 712 aa26.81■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 COA1Q9GZY4 146 aa26.81■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 UBA5Q9GZZ9 404 aa26.81■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 TXNRD1Q16881 649 aa26.81■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.81■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 LAD1O00515 517 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 SMARCA1P28370 1054 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 PRPHP41219 470 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 PAK1Q13153 545 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP26C1Q6V0L0 522 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 PLIN2Q99541 437 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 MXD3Q9BW11 206 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 RMND1Q9NWS8 449 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 PDHBP11177 359 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 ERVK-24P63145 666 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC35F6Q8N357 371 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 ACRBPQ8NEB7 543 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 NELFBQ8WX92 580 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 CCSER1Q9C0I3 900 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 C6orf50Q9HD87 102 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa26.8■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 UBA7P41226 1012 aa26.79■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 PRCPP42785 496 aa26.79■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 COPB1P53618 953 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.79■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 ERLIN1O75477 346 aa26.78■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa26.78■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 LETM2Q2VYF4 491 aa26.78■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.78■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.78■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 RIOX1Q9H6W3 641 aa26.78■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 AKR1B1P15121 316 aa26.78■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 GNA11P29992 359 aa26.78■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 TCP11X2Q5H9J9 407 aa26.78■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 NEK11Q8NG66 645 aa26.78■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 MYH8P13535 1937 aa26.78■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.78■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 SRGNP10124 158 aa26.77■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 KBTBD4Q9NVX7 518 aa26.77■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 KLRC4O43908 158 aa26.77■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 HDXQ7Z353 690 aa26.77■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 VPS16Q9H269 839 aa26.77■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.77■■□□□ 1.88
AMIGO1-201ENST00000369862 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.76■■□□□ 1.87
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNJ18B7U540 433 aa26.76■■□□□ 1.87
AMIGO1-201ENST00000369862 OR52Z1P0C646 297 aa26.76■■□□□ 1.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ARHGAP25P42331 645 aa26.76■■□□□ 1.87
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNJ12Q14500 433 aa26.76■■□□□ 1.87
AMIGO1-201ENST00000369862 DOK7Q18PE1 504 aa26.76■■□□□ 1.87
AMIGO1-201ENST00000369862 EXOC4Q96A65 974 aa26.76■■□□□ 1.87
AMIGO1-201ENST00000369862 PNKPQ96T60 521 aa26.76■■□□□ 1.87
AMIGO1-201ENST00000369862 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
AMIGO1-201ENST00000369862 PSD3Q9NYI0 1048 aa26.76■■□□□ 1.87
AMIGO1-201ENST00000369862 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
AMIGO1-201ENST00000369862 SOGA3Q5TF21 947 aa26.75■■□□□ 1.87
AMIGO1-201ENST00000369862 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms