RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF654Q8IZM8 581 aa17.41■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 NUP133Q8WUM0 1156 aa17.41■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 KCNB2Q92953 911 aa17.41■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM87BQ96K49 555 aa17.41■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 NEK1Q96PY6 1258 aa17.41■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 MTA3Q9BTC8 594 aa17.41■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PFASO15067 1338 aa17.41■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa17.41■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 HSPA4P34932 840 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SLC30A10Q6XR72 485 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 MCM3APO60318 1980 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa17.4■□□□□ 0.38
CSAG1-201ENST00000361211 SEPT4O43236 478 aa17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CYTH3O43739 400 aa17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 REC8O95072 547 aa17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CPA1P15085 419 aa17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 RXRAP19793 462 aa17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 NFXL1Q6ZNB6 911 aa17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ARMCX2Q7L311 632 aa17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ANKLE1Q8NAG6 615 aa17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MTMR8Q96EF0 704 aa17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 NRBP1Q9UHY1 535 aa17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SNX14Q9Y5W7 946 aa17.39■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC37A2A6NM11 1700 aa17.38■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PTPDC1A2A3K4 754 aa17.38■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC69A6NI79 296 aa17.38■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MSCO60682 206 aa17.38■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 DDAH1O94760 285 aa17.38■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 LIFRP42702 1097 aa17.38■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 RIOX1Q9H6W3 641 aa17.38■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CNPY2Q9Y2B0 182 aa17.38■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CAPN2P17655 700 aa17.37■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 KRT32Q14532 448 aa17.37■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 FBXO11Q86XK2 927 aa17.37■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 HOMER1Q86YM7 354 aa17.37■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D5Q92609 795 aa17.37■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PIGSQ96S52 555 aa17.37■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 KATNBL1Q9H079 304 aa17.37■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PNMA2Q9UL42 364 aa17.37■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ABCB11O95342 1321 aa17.37■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MYH6P13533 1939 aa17.37■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB5O15062 677 aa17.36■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHA8P1O95397 391 aa17.36■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CALML3P27482 149 aa17.36■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 RPS6P62753 249 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ACVR2BQ13705 512 aa17.36■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 RNF207Q6ZRF8 634 aa17.36■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 NECAB2Q7Z6G3 386 aa17.36■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SGMS1Q86VZ5 419 aa17.36■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 TMTC2Q8N394 836 aa17.36■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MAP3K14Q99558 947 aa17.36■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ALPK3Q96L96 1907 aa17.35■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 OPLAHO14841 1288 aa17.35■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ADCY6O43306 1168 aa17.35■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 AKR1A1P14550 325 aa17.35■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PIBF1Q8WXW3 757 aa17.35■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 USP26Q9BXU7 913 aa17.35■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 C11orf49Q9H6J7 331 aa17.35■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 BRPF3Q9ULD4 1205 aa17.35■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SLC12A7Q9Y666 1083 aa17.35■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ASB14A6NK59 587 aa17.34■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 COL6A1P12109 1028 aa17.34■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 APOA5Q6Q788 366 aa17.34■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MICU3Q86XE3 530 aa17.34■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 AMNQ9BXJ7 453 aa17.34■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa17.34■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 COL20A1Q9P218 1284 aa17.34■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CSAG1-201ENST00000361211 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 RARBP10826 455 aa17.33■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 KIF5BP33176 963 aa17.33■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 EEPD1Q7L9B9 569 aa17.33■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 MORC4Q8TE76 937 aa17.33■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 HTATIP2Q9BUP3 242 aa17.33■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 SPZ1Q9BXG8 430 aa17.33■□□□□ 0.36
CSAG1-201ENST00000361211 FAM184BQ9ULE4 1060 aa17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms