RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 NAPAP54920 295 aa21.02■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 PTGDRQ13258 359 aa21.02■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 PNOCQ13519 176 aa21.02■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 TMC6Q7Z403 805 aa21.02■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 GMLQ99445 158 aa21.02■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 BIN1O00499 593 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 CBFA2T2O43439 604 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 SOGA3Q5TF21 947 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 VPS33BQ9H267 617 aa21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ATP2B2Q01814 1243 aa21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF543Q08ER8 600 aa21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 TATDN1Q6P1N9 297 aa21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM65Q6PJ69 517 aa21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 TMX1Q9H3N1 280 aa21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 SMC2O95347 1197 aa21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 TBC1D8O95759 1140 aa21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 MCM7P33993 719 aa21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 YY1AP1Q9H869 796 aa21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 IFNKQ9P0W0 207 aa21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 PIM2Q9P1W9 311 aa21■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 SPDYE6P0CI01 402 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.99■□□□□ 0.953e-6■□□□□ 8.1
SPNS1-204ENST00000352260 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ZSCAN26Q16670 478 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.99■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 SMCO2A6NFE2 343 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 FOXN1O15353 648 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 OAS2P29728 719 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 EPSTI1Q96J88 318 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 C6orf50Q9HD87 102 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 MYH4Q9Y623 1939 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 TUBB4BP68371 445 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 NIM1KQ8IY84 436 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 RABGGTAQ92696 567 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 SMARCE1Q969G3 411 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 NYAP2Q9P242 653 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 INF2Q27J81 1249 aa20.97■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.97■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 PDILTQ8N807 584 aa20.97■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 NEK11Q8NG66 645 aa20.97■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 MKL1Q969V6 931 aa20.97■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.97■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 A0A087X0B3 334 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ESYT2A0FGR8 921 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 IVLP07476 585 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 GNA11P29992 359 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 POSTNQ15063 836 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 DLGAP5Q15398 846 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 IL17AQ16552 155 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 CCDC96Q2M329 555 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ISM2Q6H9L7 571 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 CLRN2A0PK11 232 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 PRR29P0C7W0 189 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 SEPT2Q15019 361 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
SPNS1-204ENST00000352260 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.95■□□□□ 0.94
SPNS1-204ENST00000352260 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SPNS1-204ENST00000352260 GDF11O95390 407 aa20.95■□□□□ 0.94
SPNS1-204ENST00000352260 MAP3K9P80192 1104 aa20.95■□□□□ 0.94
SPNS1-204ENST00000352260 BRD3Q15059 726 aa20.95■□□□□ 0.94
SPNS1-204ENST00000352260 GPR162Q16538 588 aa20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms