RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 AS3MTQ9HBK9 375 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 C6orf50Q9HD87 102 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 FAM205CA6NFA0 338 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 SMCO2A6NFE2 343 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PLA2G6O60733 806 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 YEATS4O95619 227 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 STAT2P52630 851 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 STK38Q15208 465 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 LINC00301Q8NCQ3 95 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 CDCA5Q96FF9 252 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 WDR18Q9BV38 432 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.9□□□□□ -1.3
CCR6-201ENST00000341935 PARP14Q460N5 1801 aa6.9□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ESYT2A0FGR8 921 aa6.9□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 NRDCO43847 1150 aa6.9□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.9□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PGBD1Q96JS3 809 aa6.9□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 FEM1BQ9UK73 627 aa6.9□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PNMA2Q9UL42 364 aa6.9□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CEP83Q9Y592 693 aa6.9□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 USP14P54578 494 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SNAP25P60880 206 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MTMR2Q13614 643 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 LPAR1Q92633 364 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SPTLC2O15270 562 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 GNA11P29992 359 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ADCY7P51828 1080 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MAP3K9P80192 1104 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 DGKZQ13574 1117 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SLC39A14Q15043 492 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PTPAQ15257 358 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 FAM160B2Q86V87 743 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 BICD2Q8TD16 824 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CHURC1Q8WUH1 139 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 NF2P35240 595 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ME1P48163 572 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 IREB2P48200 963 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.89□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 BACE1P56817 501 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 SPP2Q13103 211 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 VGLL4Q14135 290 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 FBXO11Q86XK2 927 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 KIFC2Q96AC6 838 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 RRAGCQ9HB90 399 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PPP6R2O75170 966 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TRAPPC10P48553 1259 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 BIRC2Q13490 618 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 KRT25Q7Z3Z0 450 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 AMNQ9BXJ7 453 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 LOC285556D6RIA3 1793 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 PTPRFP10586 1907 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TRIM75PA6NK02 468 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 POTEIP0CG38 1075 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 POTEJP0CG39 1038 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 VCAM1P19320 739 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 ATP2B1P20020 1258 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TTC38Q5R3I4 469 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CUL5Q93034 780 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 CSADQ9Y600 493 aa6.88□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CCR6-201ENST00000341935 C19orf81C9J6K1 198 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms