RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319041.6

SH3BGRL3-202, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 768 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TBCKQ8TEA7 893 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 C12orf42Q96LP6 360 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CLIC6Q96NY7 704 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SLF1Q9BQI6 1058 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 USP25Q9UHP3 1055 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ABCB11O95342 1321 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 OR52Z1P0C646 297 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 BACE1P56817 501 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MTMR2Q13614 643 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 LETM2Q2VYF4 491 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 DTHD1Q6ZMT9 781 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KIFC2Q96AC6 838 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FUCA2Q9BTY2 467 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CSRNP2Q9H175 543 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 VWA3AA6NCI4 1184 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PIK3CDO00329 1044 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ADAMTS3O15072 1205 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TYRO3Q06418 890 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PPP4R3AQ6IN85 833 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MOXD1Q6UVY6 613 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 AK8Q96MA6 479 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TMEM260Q9NX78 707 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CSADQ9Y600 493 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SCN4AP35499 1836 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 WNT7AO00755 349 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ICAM1P05362 532 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 VCAM1P19320 739 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MAP3K9P80192 1104 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SPP2Q13103 211 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 STX1AQ16623 288 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 UBE2SQ16763 222 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 USH1GQ495M9 461 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 C4orf32Q8N8J7 132 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CNNM3Q8NE01 707 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RAB34Q9BZG1 259 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ADM5C9JUS6 153 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 USP11P51784 963 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TMEM266Q2M3C6 531 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 UVSSAQ2YD98 709 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KRBA2Q6ZNG9 492 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SAMD3Q8N6K7 520 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ANO3Q9BYT9 981 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ANO10Q9NW15 660 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ZHX2Q9Y6X8 837 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 WDR90Q96KV7 1748 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MEIS2O14770 477 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ZBED4O75132 1171 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 USP2O75604 605 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FLOT1O75955 427 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GRIN1Q05586 938 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CALCRLQ16602 461 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CCDC174Q6PII3 467 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MCF2L2Q86YR7 1114 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CEP57L1Q8IYX8 460 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 CDCA5Q96FF9 252 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RBSNQ9H1K0 784 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 MYPNQ86TC9 1320 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 POLR2MP0CAP2 368 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SREBF1P36956 1147 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SNAP25P60880 206 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 VGLL4Q14135 290 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 LDHDQ86WU2 507 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 IQUBQ8NA54 791 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 FAM200AQ8TCP9 573 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SH3BGRL3-202ENST00000319041 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms