RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CXCL3-201ENST00000296026 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.15■■□□□ 1.3
CXCL3-201ENST00000296026 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CXCL3-201ENST00000296026 ASTN1O14525 1302 aa23.14■■□□□ 1.3
CXCL3-201ENST00000296026 ZMYM6O95789 1325 aa23.14■■□□□ 1.3
CXCL3-201ENST00000296026 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 ICAM1P05362 532 aa23.14■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 SLC16A2P36021 539 aa23.14■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 NKX3-2P78367 333 aa23.14■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 BEX3Q00994 111 aa23.14■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 NSMFQ6X4W1 530 aa23.14■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 RILPL2Q969X0 211 aa23.14■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.14■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.14■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 TBX21Q9UL17 535 aa23.14■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.13■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 ARVCFO00192 962 aa23.13■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 TIMP1P01033 207 aa23.13■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 HAND2P61296 217 aa23.13■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.13■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.13■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.13■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.13■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 AAMPQ13685 434 aa23.12■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.12■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 SMC5Q8IY18 1101 aa23.12■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.12■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.11■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.11■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 TLK2Q86UE8 772 aa23.11■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.11■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 LCTP09848 1927 aa23.1■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 SMPD1P17405 629 aa23.1■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.1■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 MFSD5Q6N075 450 aa23.1■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 TAPT1Q6NXT6 567 aa23.1■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 CXCL17Q6UXB2 119 aa23.1■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 FAM126BQ8IXS8 530 aa23.1■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 AP5M1Q9H0R1 490 aa23.1■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 PDHBP11177 359 aa23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 SDSP20132 328 aa23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 PTGS1P23219 599 aa23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 IQSEC1Q6DN90 963 aa23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 TTC14Q96N46 770 aa23.09■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 NFIBO00712 420 aa23.08■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.08■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.08■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.08■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 MORC4Q8TE76 937 aa23.08■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.08■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 VTA1Q9NP79 307 aa23.08■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CXCL3-201ENST00000296026 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.07■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 CABYRO75952 493 aa23.07■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF543Q08ER8 600 aa23.07■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.07■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.07■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 Q9Y3F1 56 aa23.07■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 ZEB2O60315 1214 aa23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 CD4P01730 458 aa23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 IGHDP01880 384 aa23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 CSF2RAP15509 400 aa23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 ITGA7Q13683 1181 aa23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM199Q8N511 208 aa23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 MYLIPQ8WY64 445 aa23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 ESR2Q92731 530 aa23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.06■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.05■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 SNHG28P0DPA3 235 aa23.05■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 NUCB1Q02818 461 aa23.05■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.05■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.05■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 PNMA2Q9UL42 364 aa23.05■■□□□ 1.28
CXCL3-201ENST00000296026 NEDD4P46934 1319 aa23.05■■□□□ 1.28
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