RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MIS12Q9H081 205 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 MYL1P05976 194 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 BTDP43251 543 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ATP1A2P50993 1020 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 TNFAIP1Q13829 316 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC13Q8IYE1 715 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35F6Q8N357 371 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 GLG1Q92896 1179 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ATG3Q9NT62 314 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK-7P63135 1459 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 SLAIN2Q9P270 581 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.16■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 HAUS1Q96CS2 278 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 SLFN14P0C7P3 912 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 GRM1Q13255 1194 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 XKR9Q5GH70 373 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ST7Q9NRC1 585 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PASKQ96RG2 1323 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ADORA1P30542 326 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 NIM1KQ8IY84 436 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PDE11AQ9HCR9 933 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.15■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF853P0CG23 659 aa23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ICA1Q05084 483 aa23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ARMCX5Q6P1M9 558 aa23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 EPSTI1Q96J88 318 aa23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ATP7BP35670 1465 aa23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 THAP12O43422 761 aa23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 GUCY2DQ02846 1103 aa23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.14■■□□□ 1.3
CCSAP-201ENST00000284617 ABCC12Q96J65 1359 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 LMNB1P20700 586 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 EHHADHQ08426 723 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 MAP7Q14244 749 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 PSMD6Q15008 389 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 PPM1KQ8N3J5 372 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ATP10DQ9P241 1426 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 PROSER3Q2NL68 480 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.14■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 HIP1RO75146 1068 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 IRX4P78413 519 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 SLFN13Q68D06 897 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 P2RX5Q93086 422 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 PPP4R1Q8TF05 950 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC17Q96LX7 622 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 HACE1Q8IYU2 909 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 USH1CQ9Y6N9 552 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 PPIP5K2O43314 1243 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.13■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 BPIFB4P59827 614 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 KIF3CO14782 793 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 STAM2O75886 525 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 TNNC2P02585 160 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ATF2P15336 505 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 RASSF7Q02833 373 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 IFNAR1P17181 557 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 MAN1A1P33908 653 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 KRT81Q14533 505 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 SAMD9Q5K651 1589 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ALAS1P13196 640 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ADD2P35612 726 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 STK38LQ9Y2H1 464 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.12■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 MAN2A1Q16706 1144 aa23.11■■□□□ 1.29
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms