RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 ERICH2A1L162 156 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 PRC1O43663 620 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 PDIA5Q14554 519 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 TAX1BP1Q86VP1 789 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 OSBPL9Q96SU4 736 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 EBF2Q9HAK2 575 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 TRPC6Q9Y210 931 aa24.4■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 MFN1Q8IWA4 741 aa24.39■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 FBXL16Q8N461 479 aa24.39■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 NLRP3Q96P20 1036 aa24.39■■□□□ 1.5
PITX1-201ENST00000265340 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 KLRK1P26718 216 aa24.39■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 MAGEA8P43361 318 aa24.39■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.39■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 NCOA7Q8NI08 942 aa24.39■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa24.39■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 A0A0U1RQJ8 604 aa24.38■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 MGRN1O60291 552 aa24.38■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 UBE4AQ14139 1066 aa24.38■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.38■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 PRKAB2O43741 272 aa24.37■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 LSP1P33241 339 aa24.37■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 IFT88Q13099 833 aa24.37■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 CCDC121Q6ZUS5 278 aa24.37■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 SLC51AQ86UW1 340 aa24.37■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 SPAG5Q96R06 1193 aa24.37■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 INCENPQ9NQS7 918 aa24.37■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 FAM184BQ9ULE4 1060 aa24.37■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.37■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 LCORLQ8N3X6 602 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 ACCSLQ4AC99 568 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.36■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB7AO95365 584 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 FOSBP53539 338 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 XRCC4Q13426 336 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 EMC10Q5UCC4 262 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 SLC30A9Q6PML9 568 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 OLFM4Q6UX06 510 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 LINC00301Q8NCQ3 95 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 TRIM58Q8NG06 486 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 FAM163BP0C2L3 166 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 SETSIPP0DME0 302 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 NSMCE1Q8WV22 266 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 HAUS2Q9NVX0 235 aa24.35■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 CCDC181Q5TID7 509 aa24.34■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 KDM7AQ6ZMT4 941 aa24.34■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.34■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 ABCF2Q9UG63 623 aa24.34■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.34■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.34■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 ALX1Q15699 326 aa24.34■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 TTMPQ5BVD1 217 aa24.34■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.33■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 PTGISQ16647 500 aa24.33■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 NLRP14Q86W24 1093 aa24.33■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa24.33■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 CCT8L2Q96SF2 557 aa24.33■■□□□ 1.49
PITX1-201ENST00000265340 B4E1Z4 1266 aa24.33■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 YEATS4O95619 227 aa24.33■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 PYGLP06737 847 aa24.33■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 ALS2CLQ60I27 953 aa24.33■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.33■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 FAM107AO95990 144 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 IMPDH2P12268 514 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 LMCD1Q9NZU5 365 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 C15orf41Q9Y2V0 281 aa24.32■■□□□ 1.48
PITX1-201ENST00000265340 FDPSP14324 419 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms