RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 PLXNB2O15031 1838 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF536O15090 1300 aa22.51■■□□□ 1.19
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HOXD11-201ENST00000249504 ICAM1P05362 532 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 CAP1Q01518 475 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 GPR142Q7Z601 462 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 PNMA2Q9UL42 364 aa22.51■■□□□ 1.19
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HOXD11-201ENST00000249504 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 HOMER1Q86YM7 354 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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HOXD11-201ENST00000249504 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.5■■□□□ 1.19
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HOXD11-201ENST00000249504 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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HOXD11-201ENST00000249504 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 ALAS1P13196 640 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 DDX11Q96FC9 970 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 RIPK3Q9Y572 518 aa22.49■■□□□ 1.19
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HOXD11-201ENST00000249504 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.48■■□□□ 1.19
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HOXD11-201ENST00000249504 RNF146Q9NTX7 359 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.47■■□□□ 1.19
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HOXD11-201ENST00000249504 GJB2P29033 226 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 USH1GQ495M9 461 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO11Q86XK2 927 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 CHST13Q8NET6 341 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 SRRDQ9UH36 339 aa22.47■■□□□ 1.19
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HOXD11-201ENST00000249504 PRMT2P55345 433 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 ACAD9Q9H845 621 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD11-201ENST00000249504 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
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HOXD11-201ENST00000249504 MMP19Q99542 508 aa22.46■■□□□ 1.19
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HOXD11-201ENST00000249504 KCTD2Q14681 263 aa22.45■■□□□ 1.18
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HOXD11-201ENST00000249504 GABRQQ9UN88 632 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 FLT3LGP49771 235 aa22.44■■□□□ 1.18
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HOXD11-201ENST00000249504 GRB14Q14449 540 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
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HOXD11-201ENST00000249504 RAET1EQ8TD07 263 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 KIF3AQ9Y496 699 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 ABCB11O95342 1321 aa22.44■■□□□ 1.18
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HOXD11-201ENST00000249504 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.43■■□□□ 1.18
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HOXD11-201ENST00000249504 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.43■■□□□ 1.18
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HOXD11-201ENST00000249504 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.42■■□□□ 1.18
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HOXD11-201ENST00000249504 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 CYP2B6P20813 491 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 NSMFQ6X4W1 530 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 DPP9Q86TI2 863 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 BARHL2Q9NY43 387 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXD11-201ENST00000249504 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.41■■□□□ 1.18
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