RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 TBX3O15119 743 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ASIC2Q16515 512 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 IGKV5-2P06315 115 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 CUL4BQ13620 913 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 MORC4Q8TE76 937 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 JAK3P52333 1124 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PANX2Q96RD6 677 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SPZ1Q9BXG8 430 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 VEZTQ9HBM0 779 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ABCB11O95342 1321 aa6.99□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 LPAR1Q92633 364 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 KRT9P35527 623 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PDIA5Q14554 519 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 CFAP157Q5JU67 520 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PAF1Q8N7H5 531 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 CSRNP1Q96S65 589 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PAK2Q13177 524 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 M0QZ92 97 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PFKFB1P16118 471 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 AP3M2P53677 418 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 LRRC2Q9BYS8 371 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 USP40Q9NVE5 1235 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 EVCP57679 992 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 GTF2IP78347 998 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SARNPP82979 210 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ATP2A3Q93084 1043 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ZNF233A6NK53 670 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 BMP3P12645 472 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 TFDP1Q14186 410 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 KCNB1Q14721 858 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SPATA24Q86W54 205 aa6.98□□□□□ -1.29
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SETX-201ENST00000224140 GCNT3O95395 438 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 FERP16591 822 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PPFIA3O75145 1194 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 GFPT2O94808 682 aa6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 A0A1W2PQC6 194 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 BTDP43251 543 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 FOXO4P98177 505 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PTH1RQ03431 593 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 MAN2A1Q16706 1144 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 TRPC6Q9Y210 931 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.97□□□□□ -1.29
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SETX-201ENST00000224140 SULF1Q8IWU6 871 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 USP28Q96RU2 1077 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 JRKLQ9Y4A0 524 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 TXKP42681 527 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 TRPC3Q13507 836 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 CHST3Q7LGC8 479 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 NELFBQ8WX92 580 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 IL17RAQ96F46 866 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 UBE4BO95155 1302 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 BACH1O14867 736 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 CHMP4BP1P59074 171 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 LRRC24Q50LG9 513 aa6.97□□□□□ -1.29
SETX-201ENST00000224140 KCNB2Q92953 911 aa6.97□□□□□ -1.29
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