RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 SKOR1P84550 965 aa14.56□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 ARID5AQ03989 594 aa14.56□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 MSL1Q68DK7 614 aa14.56□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.56□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.56□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 A6NNZ2 444 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 FTCDO95954 541 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 GLI1P08151 1106 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 TCP1P17987 556 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 MDH1P40925 334 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 MIEF2Q96C03 454 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF233A6NK53 670 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 RRAGAQ7L523 313 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 A0A1B0GUA9 196 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 OPLAHO14841 1288 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 ZBED6P86452 979 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 MCM8Q9UJA3 840 aa14.55□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 UBA7P41226 1012 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 KIF11P52732 1056 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 MAP3K12Q12852 859 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 TRADDQ15628 312 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 SMTNP53814 917 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 MTRQ99707 1265 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 TBX22Q9Y458 520 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 TNKSO95271 1327 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 BMP15O95972 392 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.54□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 MYH10P35580 1976 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 FAM170AA1A519 330 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 PPP1R7Q15435 360 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 ORAI2Q96SN7 254 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 MYZAPP0CAP1 466 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 PDE4DQ08499 809 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 ABCF2Q9UG63 623 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF263O14978 683 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 ITGA6P23229 1130 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 ASIC1P78348 528 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 SATB1Q01826 763 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 DDR1Q08345 913 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 CHRNA2Q15822 529 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 TCP11Q8WWU5 503 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 NUP58Q9BVL2 599 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.53□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 MST1RQ04912 1400 aa14.52□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 GCKP35557 465 aa14.52□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 LCORLQ8N3X6 602 aa14.52□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 SH2D4AQ9H788 454 aa14.52□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
ITGA3-201ENST00000007722 SMIM23A6NLE4 172 aa14.52□□□□□ -0.09
ITGA3-201ENST00000007722 SMIM22K7EJ46 135 aa14.52□□□□□ -0.09
ITGA3-201ENST00000007722 FAM107AO95990 144 aa14.52□□□□□ -0.09
ITGA3-201ENST00000007722 CLTAP09496 248 aa14.52□□□□□ -0.09
ITGA3-201ENST00000007722 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ITGA3-201ENST00000007722 UBE3CQ15386 1083 aa14.52□□□□□ -0.09
ITGA3-201ENST00000007722 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.52□□□□□ -0.09
ITGA3-201ENST00000007722 HPS3Q969F9 1004 aa14.52□□□□□ -0.09
ITGA3-201ENST00000007722 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ITGA3-201ENST00000007722 NWD2Q9ULI1 1742 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms