RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174113.7

Sumo3-209, Transcript of Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene Sumo3, Length 512 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Msgn1Q9JK54 188 aa22.55■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Suclg2Q9Z2I8 433 aa22.55■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 DcxO88809 366 aa22.54■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 CenpbP27790 599 aa22.54■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cyp2c38P56655 490 aa22.54■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rps6P62754 249 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fbln1Q08879 705 aa22.54■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Epha10Q8BYG9 1007 aa22.54■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gimap7Q8R379 293 aa22.54■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ca9Q8VHB5 437 aa22.54■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ppp6r3Q922D4 844 aa22.54■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 C87977A2A958 498 aa22.53■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Lnx1O70263 728 aa22.53■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Siah1bQ06985 282 aa22.53■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 JcadQ5DTX6 1320 aa22.53■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Sall1Q9ER74 1322 aa22.53■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa22.52■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nsrp1Q5NCR9 542 aa22.52■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ccdc158Q8CDI6 1109 aa22.52■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Atad2Q8CDM1 1040 aa22.52■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tshz3Q8CGV9 1081 aa22.52■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ptcd2Q8R3K3 381 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cmtm5Q9D6G9 156 aa22.52■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ifi202Q9R002 445 aa22.52■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Lamb2Q61292 1799 aa22.52■■□□□ 1.2
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Irgm2A0A140LIF8 407 aa22.51■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fyb2A2A995 729 aa22.51■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Hoxa11P31311 313 aa22.51■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Col6a1Q04857 1025 aa22.51■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Grm4Q68EF4 912 aa22.51■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Lrrc15Q80X72 579 aa22.51■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Paf1Q8K2T8 535 aa22.51■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Onecut3Q8K557 490 aa22.51■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Fem1bQ9Z2G0 627 aa22.51■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa22.51■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ccl26F8VQM2 93 aa22.5■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mboat4P0C7A3 435 aa22.5■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ccp110Q7TSH4 1004 aa22.5■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Dusp4Q8BFV3 398 aa22.5■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 GneQ91WG8 722 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 TroapB7ZNG4 668 aa22.49■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ppef2O35385 757 aa22.49■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 AcrP23578 436 aa22.49■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ece1Q4PZA2 769 aa22.49■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Samhd1Q60710 627 aa22.49■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Moxd2Q7TT41 619 aa22.49■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Vps37dQ810I0 261 aa22.49■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 GldcQ91W43 1025 aa22.49■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Slc5a5Q99PN0 618 aa22.49■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Chmp5Q9D7S9 219 aa22.49■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gm5114W4VSN8 858 aa22.49■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ttc6G3UYY4 1857 aa22.49■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa22.48■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tlk2O55047 718 aa22.48■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Traf3ip1Q149C2 625 aa22.48■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Oxr1Q4KMM3 866 aa22.48■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rnf20Q5DTM8 973 aa22.48■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Arhgef2Q60875 985 aa22.48■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Zfp943Q6NZP4 507 aa22.48■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 EngaseQ8BX80 734 aa22.48■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Hmg20bQ9Z104 317 aa22.48■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gcnt4E9Q649 455 aa22.47■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Nfil3O08750 462 aa22.47■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Parp3Q3ULW8 533 aa22.47■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Armc2Q3URY6 854 aa22.47■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Phlda1Q62392 405 aa22.47■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ppp2r5bQ6PD28 497 aa22.47■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Cep55Q8BT07 462 aa22.47■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Homer1Q9Z2Y3 366 aa22.47■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Col5a3Q9JLI2 1739 aa22.46■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Dnajc25A2ALW5 357 aa22.46■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gm20503G3UZK1 150 aa22.46■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Lrrc14bQ3UJB3 510 aa22.46■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tmtc2Q56A06 836 aa22.46■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Etaa1Q5SVT3 877 aa22.46■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Jakmip1Q8BVL9 626 aa22.46■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Vmn1r191Q8K4D0 298 aa22.46■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Alas1Q8VC19 642 aa22.46■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gpr108Q91WD0 569 aa22.46■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 PolkQ9QUG2 852 aa22.46■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gon4lQ9DB00 2260 aa22.46■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Obsl1D3YYU8 1804 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Vwa3bJ9JI28 736 aa22.45■■□□□ 1.18
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rad51bO35719 350 aa22.45■■□□□ 1.18
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Phka1P18826 1241 aa22.45■■□□□ 1.18
Sumo3-209ENSMUST00000174113 NcanP55066 1268 aa22.45■■□□□ 1.18
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Tp53i13Q5F267 385 aa22.45■■□□□ 1.18
Sumo3-209ENSMUST00000174113 B4galnt3Q6L8S8 986 aa22.45■■□□□ 1.18
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Gprc5cQ8K3J9 440 aa22.45■■□□□ 1.18
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Syt17Q920M7 470 aa22.45■■□□□ 1.18
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Rad9aQ9Z0F6 389 aa22.45■■□□□ 1.18
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Ces1hD3Z298 562 aa22.44■■□□□ 1.18
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Adam15O88839 864 aa22.44■■□□□ 1.18
Sumo3-209ENSMUST00000174113 Mt-CybP00158 381 aa22.44■■□□□ 1.18
Sumo3-209ENSMUST00000174113 EporP14753 507 aa22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.6 ms